Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3540857	3540891	35	24 [0]	[0] 18	rhaA	L‑rhamnose isomerase

ATCCGGGCAAAGCGCGTAATGCCAGTGAGCTACGTGCCGATCTGGAACAGGCTATGCGGCTG  >  W3110S.gb/3540892‑3540953 |                                                              aTCCGGGCAAAGCGCGTAATGCCAGTGAGCTACGTGCCGATCTGGATCACGCTATGCGGCTg  >  1:2713980/1‑62 (MQ=255) aTCCGGGCAAAGCGCGTAATGCCAGTGAGCTACGTGCCGATCTGGAACAGGCTATGCGGCt   >  1:1280950/1‑61 (MQ=255) aTCCGGGCAAAGCGCGTAATGCCAGTGAGCTACGTGCCGATCTGGAACAGGCTATGCGGCTg  >  1:2847273/1‑62 (MQ=255) aTCCGGGCAAAGCGCGTAATGCCAGTGAGCTACGTGCCGATCTGGAACAGGCTATGCGGCTg  >  1:956196/1‑62 (MQ=255) aTCCGGGCAAAGCGCGTAATGCCAGTGAGCTACGTGCCGATCTGGAACAGGCTATGCGGCTg  >  1:708870/1‑62 (MQ=255) aTCCGGGCAAAGCGCGTAATGCCAGTGAGCTACGTGCCGATCTGGAACAGGCTATGCGGCTg  >  1:640164/1‑62 (MQ=255) aTCCGGGCAAAGCGCGTAATGCCAGTGAGCTACGTGCCGATCTGGAACAGGCTATGCGGCTg  >  1:36468/1‑62 (MQ=255) aTCCGGGCAAAGCGCGTAATGCCAGTGAGCTACGTGCCGATCTGGAACAGGCTATGCGGCTg  >  1:296956/1‑62 (MQ=255) aTCCGGGCAAAGCGCGTAATGCCAGTGAGCTACGTGCCGATCTGGAACAGGCTATGCGGCTg  >  1:2919609/1‑62 (MQ=255) aTCCGGGCAAAGCGCGTAATGCCAGTGAGCTACGTGCCGATCTGGAACAGGCTATGCGGCTg  >  1:2914591/1‑62 (MQ=255) aTCCGGGCAAAGCGCGTAATGCCAGTGAGCTACGTGCCGATCTGGAACAGGCTATGCGGCTg  >  1:2913807/1‑62 (MQ=255) aTCCGGGCAAAGCGCGTAATGCCAGTGAGCTACGTGCCGATCTGGAACAGGCTATGCGGCTg  >  1:2793939/1‑62 (MQ=255) aTCCGGGCAAAGCGCGTAATGCCAGTGAGCTACGTGCCGATCTGGAACAGGCTATGCGGCTg  >  1:2197667/1‑62 (MQ=255) aTCCGGGCAAAGCGCGTAATGCCAGTGAGCTACGTGCCGATCTGGAACAGGCTATGCGGCTg  >  1:2157468/1‑62 (MQ=255) aTCCGGGCAAAGCGCGTAATGCCAGTGAGCTACGTGCCGATCTGGAACAGGCTATGCGGCTg  >  1:1983847/1‑62 (MQ=255) aTCCGGGCAAAGCGCGTAATGCCAGTGAGCTACGTGCCGATCTGGAACAGGCTATGCGGCTg  >  1:1975865/1‑62 (MQ=255) aTCCGGGCAAAGCGCGTAATGCCAGTGAGCTACGTGCCGATCTGGAACAGGCTATGCGGCTg  >  1:1827735/1‑62 (MQ=255) aTCCGGGCAAAGCGCGTAATGCCAGTGAGCTACGTGCCGATCTGGAACAGGCTATGCGGCTg  >  1:135355/1‑62 (MQ=255) |                                                              ATCCGGGCAAAGCGCGTAATGCCAGTGAGCTACGTGCCGATCTGGAACAGGCTATGCGGCTG  >  W3110S.gb/3540892‑3540953

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑