Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3612208	3612255	48	6 [0]	[0] 13	rfaH	DNA‑binding transcriptional antiterminator

CCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATTAATAAAGAGATTAAGCACAG  >  W3110S.gb/3612256‑3612317 |                                                              cccGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATTAATAAAGAGATTAAGCACAg  <  1:1142008/62‑1 (MQ=255) cccGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATTAATAAAGAGATTAAGCACAg  <  1:1444809/62‑1 (MQ=255) cccGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATTAATAAAGAGATTAAGCACAg  <  1:1446449/62‑1 (MQ=255) cccGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATTAATAAAGAGATTAAGCACAg  <  1:159012/62‑1 (MQ=255) cccGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATTAATAAAGAGATTAAGCACAg  <  1:1665261/62‑1 (MQ=255) cccGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATTAATAAAGAGATTAAGCACAg  <  1:1732683/62‑1 (MQ=255) cccGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATTAATAAAGAGATTAAGCACAg  <  1:1896135/62‑1 (MQ=255) cccGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATTAATAAAGAGATTAAGCACAg  <  1:2284780/62‑1 (MQ=255) cccGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATTAATAAAGAGATTAAGCACAg  <  1:2771743/62‑1 (MQ=255) cccGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATTAATAAAGAGATTAAGCACAg  <  1:303428/62‑1 (MQ=255) cccGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATTAATAAAGAGATTAAGCACAg  <  1:303653/62‑1 (MQ=255) cccGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATTAATAAAGAGATTAAGCACAg  <  1:638398/62‑1 (MQ=255) cccGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATTAATAAAGAGATTAAGCACAg  <  1:962053/62‑1 (MQ=255) |                                                              CCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATTAATAAAGAGATTAAGCACAG  >  W3110S.gb/3612256‑3612317

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑