Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3717088	3717129	42	32 [0]	[0] 15	atpA	F1 sector of membrane‑bound ATP synthase, alpha subunit

GCCTGCTGGGCCGTGTGGTTAACACTCTGGGTGCACCAATCGACGGTAAAGGTCCGCTGGAT  >  W3110S.gb/3717130‑3717191 |                                                              gCCTGCTGGGCCGTGTGGTTAACACTCTGGGTGCACCAATc                       >  1:2078394/1‑41 (MQ=255) gCCTGCTGGGCCGTGTGGTTAACACTCTGGGTGCACCAATCGACGGTAAAGGTCCGCTGGAt  >  1:1074775/1‑62 (MQ=255) gCCTGCTGGGCCGTGTGGTTAACACTCTGGGTGCACCAATCGACGGTAAAGGTCCGCTGGAt  >  1:1303689/1‑62 (MQ=255) gCCTGCTGGGCCGTGTGGTTAACACTCTGGGTGCACCAATCGACGGTAAAGGTCCGCTGGAt  >  1:1383751/1‑62 (MQ=255) gCCTGCTGGGCCGTGTGGTTAACACTCTGGGTGCACCAATCGACGGTAAAGGTCCGCTGGAt  >  1:1558237/1‑62 (MQ=255) gCCTGCTGGGCCGTGTGGTTAACACTCTGGGTGCACCAATCGACGGTAAAGGTCCGCTGGAt  >  1:1591416/1‑62 (MQ=255) gCCTGCTGGGCCGTGTGGTTAACACTCTGGGTGCACCAATCGACGGTAAAGGTCCGCTGGAt  >  1:1662045/1‑62 (MQ=255) gCCTGCTGGGCCGTGTGGTTAACACTCTGGGTGCACCAATCGACGGTAAAGGTCCGCTGGAt  >  1:2250758/1‑62 (MQ=255) gCCTGCTGGGCCGTGTGGTTAACACTCTGGGTGCACCAATCGACGGTAAAGGTCCGCTGGAt  >  1:2417070/1‑62 (MQ=255) gCCTGCTGGGCCGTGTGGTTAACACTCTGGGTGCACCAATCGACGGTAAAGGTCCGCTGGAt  >  1:2448091/1‑62 (MQ=255) gCCTGCTGGGCCGTGTGGTTAACACTCTGGGTGCACCAATCGACGGTAAAGGTCCGCTGGAt  >  1:2497578/1‑62 (MQ=255) gCCTGCTGGGCCGTGTGGTTAACACTCTGGGTGCACCAATCGACGGTAAAGGTCCGCTGGAt  >  1:2553767/1‑62 (MQ=255) gCCTGCTGGGCCGTGTGGTTAACACTCTGGGTGCACCAATCGACGGTAAAGGTCCGCTGGAt  >  1:503349/1‑62 (MQ=255) gCCTGCTGGGCCGTGTGGTTAACACTCTGGGTGCACCAATCGACGGTAAAGGTCCGCTGGAt  >  1:990196/1‑62 (MQ=255) gCCTGCTGGGCCGTGTGGTTAACACTCTGCGTGCACCAAt                        >  1:2859973/1‑40 (MQ=255) |                                                              GCCTGCTGGGCCGTGTGGTTAACACTCTGGGTGCACCAATCGACGGTAAAGGTCCGCTGGAT  >  W3110S.gb/3717130‑3717191

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑