Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	3832557	3832561	5	18 [0]	[0] 39	rfaQ	lipopolysaccharide core biosynthesis protein

CTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAATATC  >  W3110S.gb/3832562‑3832623 |                                                              cTTACGGATCAGTGGATTGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAatat   >  1:1103215/1‑61 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAatat   >  1:861500/1‑61 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAatat   >  1:2735086/1‑61 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAatat   >  1:2258244/1‑61 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAatat   >  1:2877384/1‑61 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAatat   >  1:1001415/1‑61 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAatat   >  1:343923/1‑61 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAatat   >  1:1892753/1‑61 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAatat   >  1:354454/1‑61 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAatat   >  1:1845648/1‑61 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAatat   >  1:379323/1‑61 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAatat   >  1:1637052/1‑61 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAatat   >  1:4457/1‑61 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAatat   >  1:568215/1‑61 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAatat   >  1:1534299/1‑61 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAatat   >  1:1416645/1‑61 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAatat   >  1:1297298/1‑61 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAatat   >  1:1121820/1‑61 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAatat   >  1:1064958/1‑61 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAatat   >  1:1032450/1‑61 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAATATc  <  1:734405/62‑1 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAATATc  <  1:829452/62‑1 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAATATc  <  1:2791466/62‑1 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAATATc  <  1:2773991/62‑1 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAATATc  <  1:1923637/62‑1 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAATATc  <  1:2624334/62‑1 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAATATc  <  1:2527345/62‑1 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAATATc  <  1:2452207/62‑1 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAATATc  <  1:2282862/62‑1 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAATATc  <  1:2058663/62‑1 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAATATc  <  1:193383/62‑1 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAATATc  <  1:1907977/62‑1 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAATATc  <  1:1883382/62‑1 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAATATc  <  1:1779471/62‑1 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAATATc  <  1:1591516/62‑1 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAATATc  <  1:1576549/62‑1 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAATATc  <  1:1563906/62‑1 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAATATc  <  1:1102101/62‑1 (MQ=255) cTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAATATc  <  1:1009977/62‑1 (MQ=255) |                                                              CTTACGGATCAGTGGATGGTGGCGCTGCTGGTACGTTGTTTACCTGCACGGATGAAAATATC  >  W3110S.gb/3832562‑3832623

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑