Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3838083	3838088	6	11 [0]	[0] 8	rfaI	UDP‑D‑galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide‑ alpha‑1,3‑D‑galactosyltransferase

GCTTAAATTATCAACTCAAAGAAAGCTTTATAAACCCAGTAACCAACGATACTATTTTTAT  >  W3110S.gb/3838089‑3838149 |                                                             gCTTAAATTATCAACTCAAAGAAAGCTTTATAAACCCAGTAACCAACGATACTATTTTTAt  <  1:1147719/61‑1 (MQ=255) gCTTAAATTATCAACTCAAAGAAAGCTTTATAAACCCAGTAACCAACGATACTATTTTTAt  <  1:1172362/61‑1 (MQ=255) gCTTAAATTATCAACTCAAAGAAAGCTTTATAAACCCAGTAACCAACGATACTATTTTTAt  <  1:133470/61‑1 (MQ=255) gCTTAAATTATCAACTCAAAGAAAGCTTTATAAACCCAGTAACCAACGATACTATTTTTAt  <  1:1420785/61‑1 (MQ=255) gCTTAAATTATCAACTCAAAGAAAGCTTTATAAACCCAGTAACCAACGATACTATTTTTAt  <  1:1883556/61‑1 (MQ=255) gCTTAAATTATCAACTCAAAGAAAGCTTTATAAACCCAGTAACCAACGATACTATTTTTAt  <  1:1916921/61‑1 (MQ=255) gCTTAAATTATCAACTCAAAGAAAGCTTTATAAACCCAGTAACCAACGATACTATTTTTAt  <  1:2470058/61‑1 (MQ=255) gCTTAAATTATCAACTCAAAGAAAGCTTTATAAACCCAGTAACCAACGATACTATTTTTAt  <  1:86432/61‑1 (MQ=255) |                                                             GCTTAAATTATCAACTCAAAGAAAGCTTTATAAACCCAGTAACCAACGATACTATTTTTAT  >  W3110S.gb/3838089‑3838149

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑