Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3838920	3838937	18	5 [0]	[0] 15	rfaJ	UDP‑D‑glucose:(galactosyl)lipopolysaccharide glucosyltransferase

TACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTAAAAAAATGGGCTGACGC  >  W3110S.gb/3838938‑3838998 |                                                             tACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTAAAAAAATGGGCTGACGc  >  1:1387369/1‑61 (MQ=255) tACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTAAAAAAATGGGCTGACGc  >  1:1393342/1‑61 (MQ=255) tACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTAAAAAAATGGGCTGACGc  >  1:1717387/1‑61 (MQ=255) tACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTAAAAAAATGGGCTGACGc  >  1:1774084/1‑61 (MQ=255) tACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTAAAAAAATGGGCTGACGc  >  1:2011126/1‑61 (MQ=255) tACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTAAAAAAATGGGCTGACGc  >  1:2013982/1‑61 (MQ=255) tACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTAAAAAAATGGGCTGACGc  >  1:2165241/1‑61 (MQ=255) tACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTAAAAAAATGGGCTGACGc  >  1:2171610/1‑61 (MQ=255) tACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTAAAAAAATGGGCTGACGc  >  1:2211500/1‑61 (MQ=255) tACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTAAAAAAATGGGCTGACGc  >  1:2238825/1‑61 (MQ=255) tACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTAAAAAAATGGGCTGACGc  >  1:2429633/1‑61 (MQ=255) tACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTAAAAAAATGGGCTGACGc  >  1:2453659/1‑61 (MQ=255) tACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTAAAAAAATGGGCTGACGc  >  1:2519029/1‑61 (MQ=255) tACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTAAAAAAATGGGCTGACGc  >  1:418104/1‑61 (MQ=255) tACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTAAAAAAATGGGCTGACGc  >  1:534049/1‑61 (MQ=255) |                                                             TACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTAAAAAAATGGGCTGACGC  >  W3110S.gb/3838938‑3838998

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑