Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3920995	3921016	22	7 [0]	[0] 30	yiaG/yiaF	predicted transcriptional regulator/conserved hypothetical protein

AGCGGGGTGAAGTCAGGGCATGCTCTGGCTATGATTCGATTCAGCCTGTCATTTAGCGTGA  >  W3110S.gb/3921017‑3921077 |                                                             aGCGGGGTGAAGTCAGGGCATGCTCTGGCTATGATTCGATTCAGCCTGTCAt           >  1:991723/1‑52 (MQ=255) aGCGGGGTGAAGTCAGGGCATGCTCTGGCTATGATTCGATTCAGCCTGTCAt           >  1:1302421/1‑52 (MQ=255) aGCGGGGTGAAGTCAGGGCATGCTCTGGCTATGATTCGATTCAGCCTGTCATTTAg       >  1:724497/1‑56 (MQ=255) aGCGGGGTGAAGTCAGGGCATGCTCTGGCTATGATTCGATTCAGCCTGTCATTTAGCGTGa  >  1:238294/1‑61 (MQ=255) aGCGGGGTGAAGTCAGGGCATGCTCTGGCTATGATTCGATTCAGCCTGTCATTTAGCGTGa  >  1:856653/1‑61 (MQ=255) aGCGGGGTGAAGTCAGGGCATGCTCTGGCTATGATTCGATTCAGCCTGTCATTTAGCGTGa  >  1:657488/1‑61 (MQ=255) aGCGGGGTGAAGTCAGGGCATGCTCTGGCTATGATTCGATTCAGCCTGTCATTTAGCGTGa  >  1:6282/1‑61 (MQ=255) aGCGGGGTGAAGTCAGGGCATGCTCTGGCTATGATTCGATTCAGCCTGTCATTTAGCGTGa  >  1:624828/1‑61 (MQ=255) aGCGGGGTGAAGTCAGGGCATGCTCTGGCTATGATTCGATTCAGCCTGTCATTTAGCGTGa  >  1:394344/1‑61 (MQ=255) aGCGGGGTGAAGTCAGGGCATGCTCTGGCTATGATTCGATTCAGCCTGTCATTTAGCGTGa  >  1:310575/1‑61 (MQ=255) aGCGGGGTGAAGTCAGGGCATGCTCTGGCTATGATTCGATTCAGCCTGTCATTTAGCGTGa  >  1:303278/1‑61 (MQ=255) aGCGGGGTGAAGTCAGGGCATGCTCTGGCTATGATTCGATTCAGCCTGTCATTTAGCGTGa  >  1:2798457/1‑61 (MQ=255) aGCGGGGTGAAGTCAGGGCATGCTCTGGCTATGATTCGATTCAGCCTGTCATTTAGCGTGa  >  1:27411/1‑61 (MQ=255) aGCGGGGTGAAGTCAGGGCATGCTCTGGCTATGATTCGATTCAGCCTGTCATTTAGCGTGa  >  1:2722036/1‑61 (MQ=255) aGCGGGGTGAAGTCAGGGCATGCTCTGGCTATGATTCGATTCAGCCTGTCATTTAGCGTGa  >  1:2444548/1‑61 (MQ=255) aGCGGGGTGAAGTCAGGGCATGCTCTGGCTATGATTCGATTCAGCCTGTCATTTAGCGTGa  >  1:2394903/1‑61 (MQ=255) aGCGGGGTGAAGTCAGGGCATGCTCTGGCTATGATTCGATTCAGCCTGTCATTTAGCGTGa  >  1:1056512/1‑61 (MQ=255) aGCGGGGTGAAGTCAGGGCATGCTCTGGCTATGATTCGATTCAGCCTGTCATTTAGCGTGa  >  1:2139161/1‑61 (MQ=255) aGCGGGGTGAAGTCAGGGCATGCTCTGGCTATGATTCGATTCAGCCTGTCATTTAGCGTGa  >  1:2018436/1‑61 (MQ=255) aGCGGGGTGAAGTCAGGGCATGCTCTGGCTATGATTCGATTCAGCCTGTCATTTAGCGTGa  >  1:1958283/1‑61 (MQ=255) aGCGGGGTGAAGTCAGGGCATGCTCTGGCTATGATTCGATTCAGCCTGTCATTTAGCGTGa  >  1:1928652/1‑61 (MQ=255) aGCGGGGTGAAGTCAGGGCATGCTCTGGCTATGATTCGATTCAGCCTGTCATTTAGCGTGa  >  1:1876118/1‑61 (MQ=255) aGCGGGGTGAAGTCAGGGCATGCTCTGGCTATGATTCGATTCAGCCTGTCATTTAGCGTGa  >  1:1848032/1‑61 (MQ=255) aGCGGGGTGAAGTCAGGGCATGCTCTGGCTATGATTCGATTCAGCCTGTCATTTAGCGTGa  >  1:1763207/1‑61 (MQ=255) aGCGGGGTGAAGTCAGGGCATGCTCTGGCTATGATTCGATTCAGCCTGTCATTTAGCGTGa  >  1:1669856/1‑61 (MQ=255) aGCGGGGTGAAGTCAGGGCATGCTCTGGCTATGATTCGATTCAGCCTGTCATTTAGCGTGa  >  1:1595224/1‑61 (MQ=255) aGCGGGGTGAAGTCAGGGCATGCTCTGGCTATGATTCGATTCAGCCTGTCATTTAGCGTGa  >  1:1532474/1‑61 (MQ=255) aGCGGGGTGAAGTCAGGGCATGCTCTGGCTATGATTCGATTCAGCCTGTCATTTAGCGTGa  >  1:1302529/1‑61 (MQ=255) aGCGGGGTGAAGTCAGGGCATGCTCTGGCTATGATTCGATTCAGCCTGTCATTTAGCGTGa  >  1:1282081/1‑61 (MQ=255) aGCGGGGTGAAGTCAGGGCATGCTCTGGCTATGATTCGATTCAGCCTGTCATTTAGCGTGa  >  1:1107601/1‑61 (MQ=255) |                                                             AGCGGGGTGAAGTCAGGGCATGCTCTGGCTATGATTCGATTCAGCCTGTCATTTAGCGTGA  >  W3110S.gb/3921017‑3921077

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑