Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3927854	3927906	53	4 [0]	[0] 20	yhjY	conserved hypothetical protein

CCTTAGGCTGGCGTGTTGACTCCCGGCTTGGCGATCTCCGACCCTGGGCGCAAATCAGCTAT  >  W3110S.gb/3927907‑3927968 |                                                              ccTTAGTCTGGCGTGTTGACTCCCGGCTTGGCGATCTCCGACCCTGGGCGCAAATCAGCtat  <  1:2857861/62‑1 (MQ=255) ccTTAGGCTGGCGTGTTGACTCCCGGCTTGGCGATCTCCGACCCTGGGCGCAAATCAGCtat  <  1:2126708/62‑1 (MQ=255) ccTTAGGCTGGCGTGTTGACTCCCGGCTTGGCGATCTCCGACCCTGGGCGCAAATCAGCtat  <  1:83862/62‑1 (MQ=255) ccTTAGGCTGGCGTGTTGACTCCCGGCTTGGCGATCTCCGACCCTGGGCGCAAATCAGCtat  <  1:756306/62‑1 (MQ=255) ccTTAGGCTGGCGTGTTGACTCCCGGCTTGGCGATCTCCGACCCTGGGCGCAAATCAGCtat  <  1:574563/62‑1 (MQ=255) ccTTAGGCTGGCGTGTTGACTCCCGGCTTGGCGATCTCCGACCCTGGGCGCAAATCAGCtat  <  1:2762902/62‑1 (MQ=255) ccTTAGGCTGGCGTGTTGACTCCCGGCTTGGCGATCTCCGACCCTGGGCGCAAATCAGCtat  <  1:2534681/62‑1 (MQ=255) ccTTAGGCTGGCGTGTTGACTCCCGGCTTGGCGATCTCCGACCCTGGGCGCAAATCAGCtat  <  1:2514847/62‑1 (MQ=255) ccTTAGGCTGGCGTGTTGACTCCCGGCTTGGCGATCTCCGACCCTGGGCGCAAATCAGCtat  <  1:2325500/62‑1 (MQ=255) ccTTAGGCTGGCGTGTTGACTCCCGGCTTGGCGATCTCCGACCCTGGGCGCAAATCAGCtat  <  1:2265450/62‑1 (MQ=255) ccTTAGGCTGGCGTGTTGACTCCCGGCTTGGCGATCTCCGACCCTGGGCGCAAATCAGCtat  <  1:102102/62‑1 (MQ=255) ccTTAGGCTGGCGTGTTGACTCCCGGCTTGGCGATCTCCGACCCTGGGCGCAAATCAGCtat  <  1:2118670/62‑1 (MQ=255) ccTTAGGCTGGCGTGTTGACTCCCGGCTTGGCGATCTCCGACCCTGGGCGCAAATCAGCtat  <  1:2116301/62‑1 (MQ=255) ccTTAGGCTGGCGTGTTGACTCCCGGCTTGGCGATCTCCGACCCTGGGCGCAAATCAGCtat  <  1:2111557/62‑1 (MQ=255) ccTTAGGCTGGCGTGTTGACTCCCGGCTTGGCGATCTCCGACCCTGGGCGCAAATCAGCtat  <  1:2045089/62‑1 (MQ=255) ccTTAGGCTGGCGTGTTGACTCCCGGCTTGGCGATCTCCGACCCTGGGCGCAAATCAGCtat  <  1:1743427/62‑1 (MQ=255) ccTTAGGCTGGCGTGTTGACTCCCGGCTTGGCGATCTCCGACCCTGGGCGCAAATCAGCtat  <  1:1620818/62‑1 (MQ=255) ccTTAGGCTGGCGTGTTGACTCCCGGCTTGGCGATCTCCGACCCTGGGCGCAAATCAGCtat  <  1:1520362/62‑1 (MQ=255) ccTTAGGCTGGCGTGTTGACTCCCGGCTTGGCGATCTCCGACCCTGGGCGCAAATCAGCtat  <  1:1493041/62‑1 (MQ=255) ccTTAGGCTGGCGTGTTGACTCCCGGCTTGGCGATCTCCGACCCTGGGCGCAAATCAGCtat  <  1:1241238/62‑1 (MQ=255) |                                                              CCTTAGGCTGGCGTGTTGACTCCCGGCTTGGCGATCTCCGACCCTGGGCGCAAATCAGCTAT  >  W3110S.gb/3927907‑3927968

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑