Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3942685	3942704	20	12 [0]	[0] 30	bcsE	conserved hypothetical protein

TATCGCCGGTACGGTTAGGGCGACACAGCGTCAGGGCTTGTTCAACGCGGATACCCGGTAC  >  W3110S.gb/3942705‑3942765 |                                                             tatCGCCGGTACGGTTAGGGCGACACAGCGTCAGGGc                          >  1:1380563/1‑37 (MQ=255) tatCGCCGGTACGGTTAGGGCGACACAGCGTCAGGGCTTGTTCAACGCGGATACCCGGTa   >  1:2697387/1‑60 (MQ=255) tatCGCCGGTACGGTTAGGGCGACACAGCGTCAGGGCTTGTTCAACGCGGATACCCGGTAc  >  1:2168207/1‑61 (MQ=255) tatCGCCGGTACGGTTAGGGCGACACAGCGTCAGGGCTTGTTCAACGCGGATACCCGGTAc  >  1:95354/1‑61 (MQ=255) tatCGCCGGTACGGTTAGGGCGACACAGCGTCAGGGCTTGTTCAACGCGGATACCCGGTAc  >  1:825440/1‑61 (MQ=255) tatCGCCGGTACGGTTAGGGCGACACAGCGTCAGGGCTTGTTCAACGCGGATACCCGGTAc  >  1:582365/1‑61 (MQ=255) tatCGCCGGTACGGTTAGGGCGACACAGCGTCAGGGCTTGTTCAACGCGGATACCCGGTAc  >  1:518916/1‑61 (MQ=255) tatCGCCGGTACGGTTAGGGCGACACAGCGTCAGGGCTTGTTCAACGCGGATACCCGGTAc  >  1:518451/1‑61 (MQ=255) tatCGCCGGTACGGTTAGGGCGACACAGCGTCAGGGCTTGTTCAACGCGGATACCCGGTAc  >  1:395156/1‑61 (MQ=255) tatCGCCGGTACGGTTAGGGCGACACAGCGTCAGGGCTTGTTCAACGCGGATACCCGGTAc  >  1:295948/1‑61 (MQ=255) tatCGCCGGTACGGTTAGGGCGACACAGCGTCAGGGCTTGTTCAACGCGGATACCCGGTAc  >  1:2732597/1‑61 (MQ=255) tatCGCCGGTACGGTTAGGGCGACACAGCGTCAGGGCTTGTTCAACGCGGATACCCGGTAc  >  1:2703749/1‑61 (MQ=255) tatCGCCGGTACGGTTAGGGCGACACAGCGTCAGGGCTTGTTCAACGCGGATACCCGGTAc  >  1:2471700/1‑61 (MQ=255) tatCGCCGGTACGGTTAGGGCGACACAGCGTCAGGGCTTGTTCAACGCGGATACCCGGTAc  >  1:2387856/1‑61 (MQ=255) tatCGCCGGTACGGTTAGGGCGACACAGCGTCAGGGCTTGTTCAACGCGGATACCCGGTAc  >  1:224114/1‑61 (MQ=255) tatCGCCGGTACGGTTAGGGCGACACAGCGTCAGGGCTTGTTCAACGCGGATACCCGGTAc  >  1:1045629/1‑61 (MQ=255) tatCGCCGGTACGGTTAGGGCGACACAGCGTCAGGGCTTGTTCAACGCGGATACCCGGTAc  >  1:2050453/1‑61 (MQ=255) tatCGCCGGTACGGTTAGGGCGACACAGCGTCAGGGCTTGTTCAACGCGGATACCCGGTAc  >  1:2042866/1‑61 (MQ=255) tatCGCCGGTACGGTTAGGGCGACACAGCGTCAGGGCTTGTTCAACGCGGATACCCGGTAc  >  1:2026827/1‑61 (MQ=255) tatCGCCGGTACGGTTAGGGCGACACAGCGTCAGGGCTTGTTCAACGCGGATACCCGGTAc  >  1:196551/1‑61 (MQ=255) tatCGCCGGTACGGTTAGGGCGACACAGCGTCAGGGCTTGTTCAACGCGGATACCCGGTAc  >  1:1935835/1‑61 (MQ=255) tatCGCCGGTACGGTTAGGGCGACACAGCGTCAGGGCTTGTTCAACGCGGATACCCGGTAc  >  1:1882995/1‑61 (MQ=255) tatCGCCGGTACGGTTAGGGCGACACAGCGTCAGGGCTTGTTCAACGCGGATACCCGGTAc  >  1:1790386/1‑61 (MQ=255) tatCGCCGGTACGGTTAGGGCGACACAGCGTCAGGGCTTGTTCAACGCGGATACCCGGTAc  >  1:1548353/1‑61 (MQ=255) tatCGCCGGTACGGTTAGGGCGACACAGCGTCAGGGCTTGTTCAACGCGGATACCCGGTAc  >  1:1542702/1‑61 (MQ=255) tatCGCCGGTACGGTTAGGGCGACACAGCGTCAGGGCTTGTTCAACGCGGATACCCGGTAc  >  1:147546/1‑61 (MQ=255) tatCGCCGGTACGGTTAGGGCGACACAGCGTCAGGGCTTGTTCAACGCGGATACCCGGTAc  >  1:1271361/1‑61 (MQ=255) tatCGCCGGTACGGTTAGGGCGACACAGCGTCAGGGCTTGTTCAACGCGGATACCCGGTAc  >  1:1123510/1‑61 (MQ=255) tatCGCCGGTACGGTTAGGGCGACACAGCGTCAGGGCTTGTTCAACGCGGATACCCGGTAc  >  1:1088253/1‑61 (MQ=255) tatCGCCGGTACGGTTAGGGCGACACAGCGTCAGAGCTTGTTCAACGCGGATACCCGGTAc  >  1:2689706/1‑61 (MQ=255) |                                                             TATCGCCGGTACGGTTAGGGCGACACAGCGTCAGGGCTTGTTCAACGCGGATACCCGGTAC  >  W3110S.gb/3942705‑3942765

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑