Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3958004	3958023	20	11 [0]	[0] 29	dctA	C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter

TCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGAT  >  W3110S.gb/3958024‑3958084 |                                                             tCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGAt  <  1:2171031/61‑1 (MQ=255) tCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGAt  <  1:972934/61‑1 (MQ=255) tCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGAt  <  1:9356/61‑1 (MQ=255) tCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGAt  <  1:867509/61‑1 (MQ=255) tCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGAt  <  1:856827/61‑1 (MQ=255) tCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGAt  <  1:541786/61‑1 (MQ=255) tCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGAt  <  1:519020/61‑1 (MQ=255) tCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGAt  <  1:2844017/61‑1 (MQ=255) tCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGAt  <  1:2685457/61‑1 (MQ=255) tCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGAt  <  1:2579699/61‑1 (MQ=255) tCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGAt  <  1:2483334/61‑1 (MQ=255) tCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGAt  <  1:2478801/61‑1 (MQ=255) tCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGAt  <  1:2360072/61‑1 (MQ=255) tCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGAt  <  1:2310289/61‑1 (MQ=255) tCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGAt  <  1:2240888/61‑1 (MQ=255) tCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGAt  <  1:11252/61‑1 (MQ=255) tCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGAt  <  1:2137383/61‑1 (MQ=255) tCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGAt  <  1:2094458/61‑1 (MQ=255) tCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGAt  <  1:208275/61‑1 (MQ=255) tCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGAt  <  1:1873340/61‑1 (MQ=255) tCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGAt  <  1:1865504/61‑1 (MQ=255) tCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGAt  <  1:1859868/61‑1 (MQ=255) tCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGAt  <  1:1826263/61‑1 (MQ=255) tCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGAt  <  1:1689310/61‑1 (MQ=255) tCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGAt  <  1:1392721/61‑1 (MQ=255) tCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGAt  <  1:1379180/61‑1 (MQ=255) tCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGAt  <  1:1301861/61‑1 (MQ=255) tCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGAt  <  1:1179065/61‑1 (MQ=255) tCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGAt  <  1:1139286/61‑1 (MQ=255) |                                                             TCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGAT  >  W3110S.gb/3958024‑3958084

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑