Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3961687	3961709	23	24 [0]	[0] 15	yhjH	EAL domain containing protein involved in flagellar function

GGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCGTTATGACTACATCAAAATCGC  >  W3110S.gb/3961710‑3961771 |                                                              ggTACCTGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCGTTATGACTACATCAAAATcgc  >  1:153839/1‑62 (MQ=255) ggTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCGTTATGACTACATCAAAATcgt  >  1:2728337/1‑61 (MQ=255) ggTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCGTTATGACTACATCAAAATcgc  >  1:1054915/1‑62 (MQ=255) ggTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCGTTATGACTACATCAAAATcgc  >  1:1070844/1‑62 (MQ=255) ggTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCGTTATGACTACATCAAAATcgc  >  1:1255709/1‑62 (MQ=255) ggTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCGTTATGACTACATCAAAATcgc  >  1:1309107/1‑62 (MQ=255) ggTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCGTTATGACTACATCAAAATcgc  >  1:1527355/1‑62 (MQ=255) ggTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCGTTATGACTACATCAAAATcgc  >  1:1960865/1‑62 (MQ=255) ggTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCGTTATGACTACATCAAAATcgc  >  1:1979950/1‑62 (MQ=255) ggTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCGTTATGACTACATCAAAATcgc  >  1:2311533/1‑62 (MQ=255) ggTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCGTTATGACTACATCAAAATcgc  >  1:2708762/1‑62 (MQ=255) ggTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCGTTATGACTACATCAAAATcgc  >  1:2839305/1‑62 (MQ=255) ggTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCGTTATGACTACATCAAAATcgc  >  1:589250/1‑62 (MQ=255) ggTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCGTTATGACTACATCAAAATcg   >  1:1003745/1‑61 (MQ=255) ggTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCGTTATGACTACATCAAAATc    >  1:1517397/1‑60 (MQ=255) |                                                              GGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCGTTATGACTACATCAAAATCGC  >  W3110S.gb/3961710‑3961771

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑