Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4009282	4009285	4	29 [0]	[0] 49	yhiJ	hypothetical protein

CCCGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAGCATGCATAATTGCCAAATTAACCCTGG  >  W3110S.gb/4009286‑4009346 |                                                             cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAgcatgcat                      >  1:495196/1‑41 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAgcatgcat                      >  1:2312311/1‑41 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAgcatgcat                      >  1:2168186/1‑41 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAgcatgcat                      >  1:2590035/1‑41 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAgcatgcat                      >  1:2642770/1‑41 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAgcatgcat                      >  1:2802388/1‑41 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAgcatgcat                      >  1:188752/1‑41 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAgcatgcat                      >  1:1745833/1‑41 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAgcatgcat                      >  1:427827/1‑41 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAgcatgcat                      >  1:1514662/1‑41 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAgcatgcat                      >  1:1503256/1‑41 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAgcatgcat                      >  1:1499864/1‑41 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAgcatgcat                      >  1:990824/1‑41 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAgcatgcat                      >  1:1417879/1‑41 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAgcatgcat                      >  1:1321383/1‑41 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAgcatgcat                      >  1:1313663/1‑41 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAgcatgcat                      >  1:707227/1‑41 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAgcatgcat                      >  1:551151/1‑41 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAgcatgcat                      >  1:590263/1‑41 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAgcatgcat                      >  1:1448761/1‑41 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAgcatgcat                      >  1:557503/1‑41 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAgcatgcat                      >  1:1084784/1‑41 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAGCATGCATAATTGCCAAATTAACCCTgg  >  1:330473/1‑61 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAGCATGCATAATTGCCAAATTAACCCTgg  >  1:2491111/1‑61 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAGCATGCATAATTGCCAAATTAACCCTgg  >  1:2617786/1‑61 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAGCATGCATAATTGCCAAATTAACCCTgg  >  1:2683147/1‑61 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAGCATGCATAATTGCCAAATTAACCCTgg  >  1:372318/1‑61 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAGCATGCATAATTGCCAAATTAACCCTgg  >  1:426552/1‑61 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAGCATGCATAATTGCCAAATTAACCCTgg  >  1:2108128/1‑61 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAGCATGCATAATTGCCAAATTAACCCTgg  >  1:513657/1‑61 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAGCATGCATAATTGCCAAATTAACCCTgg  >  1:1931243/1‑61 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAGCATGCATAATTGCCAAATTAACCCTgg  >  1:1026396/1‑61 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAGCATGCATAATTGCCAAATTAACCCTgg  >  1:103519/1‑61 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAGCATGCATAATTGCCAAATTAACCCTgg  >  1:1071871/1‑61 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAGCATGCATAATTGCCAAATTAACCCTgg  >  1:1157419/1‑61 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAGCATGCATAATTGCCAAATTAACCCTgg  >  1:1444740/1‑61 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAGCATGCATAATTGCCAAATTAACCCTgg  >  1:1656909/1‑61 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAGCATGCATAATTGCCAAATTAACCCTgg  >  1:1691431/1‑61 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAGCATGCATAATTGCCAAATTAACCCTgg  >  1:1754578/1‑61 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAGCATGCATAATTGCCAAATTAACCCTgg  >  1:225927/1‑61 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAGCATGCATAATTGCCAAATTAACCCTgg  >  1:1962347/1‑61 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAGCATGCATAATTGCCAAATTAACCCTgg  >  1:2001112/1‑61 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAGCATGCATAATTGCCAAATTAACCCTgg  >  1:2006710/1‑61 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAGCATGCATAATTGCCAAATTAACCCTgg  >  1:2143880/1‑61 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAGCATGCATAATTGCCAAATTAACCCTgg  >  1:2164390/1‑61 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAGCATGCATAATTGCCAAATTAACCCTgg  >  1:21770/1‑61 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAGCATGCATAATTGCCAAATTAACCCTgg  >  1:2241700/1‑61 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAGCATGCATAATTGCCAAATTAACCCTg   >  1:1015043/1‑60 (MQ=255) cccGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGATCAgcatgcat                      >  1:1188220/1‑41 (MQ=255) |                                                             CCCGTGACAGTAAACATGCTGGAAGAATGTTCAGCATGCATAATTGCCAAATTAACCCTGG  >  W3110S.gb/4009286‑4009346

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑