Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4073732	4073734	3	11 [0]	[0] 40	glgA	glycogen synthase

TGCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGA  >  W3110S.gb/4073735‑4073795 |                                                             tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCg     <  1:2575689/58‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCg     <  1:2915807/58‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCg     <  1:1835450/58‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:323181/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:2592439/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:2599673/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:2620590/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:2648149/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:2706268/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:278582/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:2859201/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:969859/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:437522/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:440906/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:530029/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:563129/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:573065/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:685991/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:713897/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:943485/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:1035460/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:1682112/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:1145687/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:1157245/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:1452214/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:1470481/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:149018/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:1502430/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:1675034/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:2527069/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:1802347/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:1905832/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:1948042/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:1996209/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:2039020/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:2159115/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:2350925/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:2362494/61‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCCCGGCGAAGTCGTACCg     <  1:680750/58‑1 (MQ=255) tgCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGGCGCGGCGAAGTCGTACCGTGa  <  1:1389007/61‑1 (MQ=255) |                                                             TGCAACGTCAGGCTATGGCAATGGATTTTAGCTGGCAGGTCGCGGCGAAGTCGTACCGTGA  >  W3110S.gb/4073735‑4073795

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑