Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4082811	4082839	29	9 [0]	[0] 27	rtcB	conserved hypothetical protein

CACTTTATTGAAATCTGCCTTGATGAGTCGGACCAGGTG  >  W3110S.gb/4082840‑4082878 |                                       cACTTTATTGAAATCTGCCTTGATGAGTCGGACCAGgtg  <  1:2293862/39‑1 (MQ=255) cACTTTATTGAAATCTGCCTTGATGAGTCGGACCAGgtg  <  1:801080/39‑1 (MQ=255) cACTTTATTGAAATCTGCCTTGATGAGTCGGACCAGgtg  <  1:781277/39‑1 (MQ=255) cACTTTATTGAAATCTGCCTTGATGAGTCGGACCAGgtg  <  1:773626/39‑1 (MQ=255) cACTTTATTGAAATCTGCCTTGATGAGTCGGACCAGgtg  <  1:555128/39‑1 (MQ=255) cACTTTATTGAAATCTGCCTTGATGAGTCGGACCAGgtg  <  1:431988/39‑1 (MQ=255) cACTTTATTGAAATCTGCCTTGATGAGTCGGACCAGgtg  <  1:34791/39‑1 (MQ=255) cACTTTATTGAAATCTGCCTTGATGAGTCGGACCAGgtg  <  1:294909/39‑1 (MQ=255) cACTTTATTGAAATCTGCCTTGATGAGTCGGACCAGgtg  <  1:266809/39‑1 (MQ=255) cACTTTATTGAAATCTGCCTTGATGAGTCGGACCAGgtg  <  1:2637054/39‑1 (MQ=255) cACTTTATTGAAATCTGCCTTGATGAGTCGGACCAGgtg  <  1:2634893/39‑1 (MQ=255) cACTTTATTGAAATCTGCCTTGATGAGTCGGACCAGgtg  <  1:2634343/39‑1 (MQ=255) cACTTTATTGAAATCTGCCTTGATGAGTCGGACCAGgtg  <  1:2425028/39‑1 (MQ=255) cACTTTATTGAAATCTGCCTTGATGAGTCGGACCAGgtg  <  1:2421174/39‑1 (MQ=255) cACTTTATTGAAATCTGCCTTGATGAGTCGGACCAGgtg  <  1:1145180/39‑1 (MQ=255) cACTTTATTGAAATCTGCCTTGATGAGTCGGACCAGgtg  <  1:2211735/39‑1 (MQ=255) cACTTTATTGAAATCTGCCTTGATGAGTCGGACCAGgtg  <  1:1944544/39‑1 (MQ=255) cACTTTATTGAAATCTGCCTTGATGAGTCGGACCAGgtg  <  1:1878676/39‑1 (MQ=255) cACTTTATTGAAATCTGCCTTGATGAGTCGGACCAGgtg  <  1:185850/39‑1 (MQ=255) cACTTTATTGAAATCTGCCTTGATGAGTCGGACCAGgtg  <  1:179176/39‑1 (MQ=255) cACTTTATTGAAATCTGCCTTGATGAGTCGGACCAGgtg  <  1:1758086/39‑1 (MQ=255) cACTTTATTGAAATCTGCCTTGATGAGTCGGACCAGgtg  <  1:1714910/39‑1 (MQ=255) cACTTTATTGAAATCTGCCTTGATGAGTCGGACCAGgtg  <  1:1682118/39‑1 (MQ=255) cACTTTATTGAAATCTGCCTTGATGAGTCGGACCAGgtg  <  1:1572161/39‑1 (MQ=255) cACTTTATTGAAATCTGCCTTGATGAGTCGGACCAGgtg  <  1:1498732/39‑1 (MQ=255) cACTTTATTGAAATCTGCCTTGATGAGTCGGACCAGgtg  <  1:1381206/39‑1 (MQ=255) cACTTTATTGAAATCTGCCTTGATGAGTCGGACCAGgtg  <  1:1230154/39‑1 (MQ=255) |                                       CACTTTATTGAAATCTGCCTTGATGAGTCGGACCAGGTG  >  W3110S.gb/4082840‑4082878

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑