Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4105060	4105101	42	9 [0]	[0] 6	envZ	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with OmpR

CCGTTGGTCGATCTCGAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGTAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCT  >  W3110S.gb/4105102‑4105163 |                                                              ccgTTGGTCGATCTCGAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGTAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCt  <  1:2047823/62‑1 (MQ=255) ccgTTGGTCGATCTCGAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGTAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCt  <  1:2457490/62‑1 (MQ=255) ccgTTGGTCGATCTCGAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGTAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCt  <  1:2526991/62‑1 (MQ=255) ccgTTGGTCGATCTCGAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGTAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCt  <  1:2714262/62‑1 (MQ=255) ccgTTGGTCGATCTCGAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGTAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCt  <  1:671879/62‑1 (MQ=255) ccgTTGGTCGATCTCGAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGGAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCt  <  1:2453669/62‑1 (MQ=255) |                                                              CCGTTGGTCGATCTCGAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGTAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCT  >  W3110S.gb/4105102‑4105163

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑