Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4201776	4201792	17	2 [0]	[0] 41	yhdL	conserved hypothetical protein

GGGCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTCC  >  W3110S.gb/4201793‑4201844 |                                                    gggCAGGTAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:408494/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTAtt    >  1:1518214/1‑50 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:538853/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:2589585/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:259278/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:2593845/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:2767251/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:40453/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:412194/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:418656/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:492166/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:538771/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:2578248/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:560192/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:566551/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:597218/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:683222/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:694535/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:813470/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:887341/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:989114/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:2142912/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:1152814/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:1158334/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:1397756/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:1754197/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:1758444/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:2030308/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:2068902/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:2096623/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:1128853/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:2145760/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:220178/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:2274185/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:2409097/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:245271/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:2468284/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:2478039/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:2511028/1‑52 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTc   >  1:1975081/1‑51 (MQ=255) gggCAGATAAAGGATAATGCGAT‑‑AAGCATTACTACATGATCCCTTATTcc  >  1:368726/1‑50 (MQ=38) |                                                    GGGCAGATAAAGGATAATGCGATAGAAGCATTACTACATGATCCCTTATTCC  >  W3110S.gb/4201793‑4201844

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑