Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4248300	4248358	59	22 [1]	[0] 40	malF	maltose transporter subunit

TTCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAC  >  W3110S.gb/4248359‑4248418 |                                                            ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTGGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:2606582/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATgg               >  1:217830/1‑47 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:459226/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:2576074/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:2600606/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:2644139/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:2704993/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:2721722/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:2737102/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:2849466/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:341924/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:2547317/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:464011/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:560134/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:845070/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:865791/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:882941/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:953610/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:958476/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:964909/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:992591/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:2043642/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:1315116/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:1371011/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:140977/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:1445831/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:1581640/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:1731278/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:1894450/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:1953689/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:1079321/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:2051299/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:2186071/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:2232685/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:2240366/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:2294696/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:2360854/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:2460410/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAc  >  1:2496093/1‑60 (MQ=255) ttCAAAAGTCAGCTGGTTAGAGCTGCTCTAGTTGGt                          >  1:1449249/1‑36 (MQ=38) |                                                            TTCAAAAGTCAGCTGGTTAGTGCTGCTGTAGTTGGTGAAGGCAATGGCGATGGTGCAGAC  >  W3110S.gb/4248359‑4248418

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑