Missing coverage evidence...
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ATGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTACC  >  W3110S.gb/219604‑219656 |                                                     aTGTTAAGCGCAGAACCGATTCATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:410785/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATGGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:1816584/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTTGCGTAcc  <  1:2435460/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:56633/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:2524825/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:2528055/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:2615809/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:2825039/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:2922032/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:402463/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:428394/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:479727/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:1130460/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:600821/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:659400/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:697195/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:802960/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:803095/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:850641/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:905632/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:906805/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:913256/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:2329430/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:1094681/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:1260241/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:1366968/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:1386806/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:1391516/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:1466764/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:1616286/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:164103/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:1846852/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:1858037/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:1925024/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:2105712/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:2153705/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:2264999/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:2269251/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:2272336/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:232061/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAcc  <  1:2460920/53‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTAca  <  1:92181/53‑2 (MQ=255) |                                                     ATGTTAAGCGCAGAACCGATACATACAGCCTGACGATAGCAGCCTGGCGTACC  >  W3110S.gb/219604‑219656

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑