Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4361533	4361535	3	9 [0]	[0] 35	cadA	lysine decarboxylase 1

CCTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACG  >  W3110S.gb/4361536‑4361575 |                                        ccTGAATACGCTTGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:750389/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:434881/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:2710834/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:271837/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:2758386/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:2892965/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:2896861/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:2904806/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:345240/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:412189/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:2696958/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:541352/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:548104/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:551544/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:593576/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:633111/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:877380/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:919746/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:1949288/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:1080131/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:1205266/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:1217298/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:1278794/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:1315396/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:1339966/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:1729113/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:1947340/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:1071642/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:2229290/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:2384139/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:2422775/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:2448846/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:2465951/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:2513306/40‑1 (MQ=255) ccTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACg  <  1:2579911/40‑1 (MQ=255) |                                        CCTGAATACGCATGTTTTCATAGAATTCAGGATCTTCACG  >  W3110S.gb/4361536‑4361575

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑