Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4431058	4431132	75	2 [0]	[0] 43	rplI	50S ribosomal subunit protein L9

TTCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGTT  >  W3110S.gb/4431133‑4431191 |                                                           ttCGTCTGCCGACCGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:2647101/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGaa                       >  1:685185/1‑38 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGa                  >  1:657383/1‑43 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:305937/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:2396903/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:2419055/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:2482800/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:2644697/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:2690143/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:2727713/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:2774885/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:2823478/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:2859647/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:2349181/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:362830/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:451727/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:641162/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:686570/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:741183/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:95083/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:986695/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:1706038/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:1178395/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:1192227/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:1297714/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:132703/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:1367520/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:1378093/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:1567545/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:1689559/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:1705482/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:1104482/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:1821483/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:1844956/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:1862695/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:188625/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:1940214/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:2063731/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:2114343/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:2186705/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:2298604/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:2301890/1‑59 (MQ=255) ttCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACAACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGtt  >  1:46361/1‑59 (MQ=255) |                                                           TTCGTCTGCCGAACGGCGTTCTGCGTACCACTGGCGAACACGAAGTGAGCTTCCAGGTT  >  W3110S.gb/4431133‑4431191

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑