Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4479985	4480011	27	3 [1]	[0] 42	[yjgK]	[yjgK]

AATAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATATTT  >  W3110S.gb/4480012‑4480062 |                                                   aaTAAGTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:261801/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTTTGAAAAGAGCGTTTTTTGata     <  1:1380605/48‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGata     <  1:928596/48‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGata     <  1:2531788/48‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGata     <  1:137353/48‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGata     <  1:26945/48‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGata     <  1:40609/48‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGata     <  1:1878050/48‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:2321910/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:222399/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:2565167/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:2644787/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:2729518/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:273040/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:2734620/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:2757847/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:2819865/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:458986/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:590255/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:610958/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:683089/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:800550/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:915828/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:1745046/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:1068031/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:1147865/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:1222265/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:1398168/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:1472343/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:1587041/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:1592068/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:1624455/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:1689070/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:223094/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:1795609/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:1828648/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:1986116/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:2102071/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:2126625/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:2159881/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:2201360/51‑1 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATAttt  <  1:1009302/51‑1 (MQ=255) |                                                   AATAACTCAAGGTTTACGGCGAGTTTGTGAAAAGAGCGTTTTTTGATATTT  >  W3110S.gb/4480012‑4480062

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑