Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4523422	4523444	23	33 [0]	[0] 24	insA insB insB	IS1 repressor protein InsA ECK0022:JW4255:b4563; IS1 transposase InsAB', N‑ter fragment ECK0022:JW4255+JW4256:b4576; IS1 transposase InsAB'

GGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACAACCGGGCAG  >  W3110S.gb/4523445‑4523506 |                                                              ggTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACAACCGGTCAg  <  1:416546/62‑1 (MQ=255) ggTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACAACCGGGCAg  <  1:2832155/62‑1 (MQ=39) ggTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACAACCGGGCAg  <  1:966083/62‑1 (MQ=39) ggTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACAACCGGGCAg  <  1:742658/62‑1 (MQ=39) ggTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACAACCGGGCAg  <  1:590018/62‑1 (MQ=39) ggTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACAACCGGGCAg  <  1:550154/62‑1 (MQ=39) ggTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACAACCGGGCAg  <  1:540124/62‑1 (MQ=39) ggTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACAACCGGGCAg  <  1:529959/62‑1 (MQ=39) ggTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACAACCGGGCAg  <  1:353216/62‑1 (MQ=39) ggTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACAACCGGGCAg  <  1:333384/62‑1 (MQ=39) ggTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACAACCGGGCAg  <  1:312405/62‑1 (MQ=39) ggTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACAACCGGGCAg  <  1:2884256/62‑1 (MQ=39) ggTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACAACCGGGCAg  <  1:1037016/62‑1 (MQ=39) ggTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACAACCGGGCAg  <  1:2830299/62‑1 (MQ=39) ggTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACAACCGGGCAg  <  1:2801230/62‑1 (MQ=39) ggTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACAACCGGGCAg  <  1:2498870/62‑1 (MQ=39) ggTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACAACCGGGCAg  <  1:2404285/62‑1 (MQ=39) ggTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACAACCGGGCAg  <  1:2094250/62‑1 (MQ=39) ggTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACAACCGGGCAg  <  1:1969851/62‑1 (MQ=39) ggTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACAACCGGGCAg  <  1:1660850/62‑1 (MQ=39) ggTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACAACCGGGCAg  <  1:160879/62‑1 (MQ=39) ggTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACAACCGGGCAg  <  1:1599024/62‑1 (MQ=39) ggTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACAACCGGGCAg  <  1:1513464/62‑1 (MQ=39) ggTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACAACCGGGCAg  <  1:1415174/62‑1 (MQ=39) |                                                              GGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACAACCGGGCAG  >  W3110S.gb/4523445‑4523506

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑