Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4546450	4546478	29	9 [0]	[0] 9	fimB/fimE	tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA/tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA

TTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCA  >  W3110S.gb/4546479‑4546539 |                                                             ttATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGaatcaaatca  <  1:1042209/61‑1 (MQ=255) ttATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGaatcaaatca  <  1:107709/61‑1 (MQ=255) ttATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGaatcaaatca  <  1:1519354/61‑1 (MQ=255) ttATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGaatcaaatca  <  1:1943599/61‑1 (MQ=255) ttATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGaatcaaatca  <  1:1991993/61‑1 (MQ=255) ttATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGaatcaaatca  <  1:2311254/61‑1 (MQ=255) ttATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGaatcaaatca  <  1:40558/61‑1 (MQ=255) ttATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGaatcaaatca  <  1:732880/61‑1 (MQ=255) ttATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGaatcaaatca  <  1:900789/61‑1 (MQ=255) |                                                             TTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCA  >  W3110S.gb/4546479‑4546539

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑