Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4551799	4551801	3	5 [0]	[0] 15	fimD	outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis

TGGTTACGGCAATGCCAATATCGGTTACAGCCATAGCGATGATATTAAGCAGCTCTATTA  >  W3110S.gb/4551802‑4551861 |                                                            tggtTACGGCAATGCCAATATCGGTTACAGCCATAGCGATGATATTAAGCAGCTCTATTa  >  1:1157456/1‑60 (MQ=255) tggtTACGGCAATGCCAATATCGGTTACAGCCATAGCGATGATATTAAGCAGCTCTATTa  >  1:1352189/1‑60 (MQ=255) tggtTACGGCAATGCCAATATCGGTTACAGCCATAGCGATGATATTAAGCAGCTCTATTa  >  1:1380172/1‑60 (MQ=255) tggtTACGGCAATGCCAATATCGGTTACAGCCATAGCGATGATATTAAGCAGCTCTATTa  >  1:147408/1‑60 (MQ=255) tggtTACGGCAATGCCAATATCGGTTACAGCCATAGCGATGATATTAAGCAGCTCTATTa  >  1:1661607/1‑60 (MQ=255) tggtTACGGCAATGCCAATATCGGTTACAGCCATAGCGATGATATTAAGCAGCTCTATTa  >  1:199393/1‑60 (MQ=255) tggtTACGGCAATGCCAATATCGGTTACAGCCATAGCGATGATATTAAGCAGCTCTATTa  >  1:2113792/1‑60 (MQ=255) tggtTACGGCAATGCCAATATCGGTTACAGCCATAGCGATGATATTAAGCAGCTCTATTa  >  1:2276716/1‑60 (MQ=255) tggtTACGGCAATGCCAATATCGGTTACAGCCATAGCGATGATATTAAGCAGCTCTATTa  >  1:2475292/1‑60 (MQ=255) tggtTACGGCAATGCCAATATCGGTTACAGCCATAGCGATGATATTAAGCAGCTCTATTa  >  1:2727291/1‑60 (MQ=255) tggtTACGGCAATGCCAATATCGGTTACAGCCATAGCGATGATATTAAGCAGCTCTATTa  >  1:313546/1‑60 (MQ=255) tggtTACGGCAATGCCAATATCGGTTACAGCCATAGCGATGATATTAAGCAGCTCTATTa  >  1:525076/1‑60 (MQ=255) tggtTACGGCAATGCCAATATCGGTTACAGCCATAGCGATGATATTAAGCAGCTCTATTa  >  1:713541/1‑60 (MQ=255) tggtTACGGCAATGCCAATATCGGTTACAGCCATAGCGATGATATTAAGCAGCTCTATTa  >  1:724635/1‑60 (MQ=255) tggtTACGGCAATGCCAATATCGGTTACAGCCATAGCGATGATATTAAGCAGCTCTATTa  >  1:82564/1‑60 (MQ=255) |                                                            TGGTTACGGCAATGCCAATATCGGTTACAGCCATAGCGATGATATTAAGCAGCTCTATTA  >  W3110S.gb/4551802‑4551861

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑