Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4551885	4551952	68	9 [0]	[0] 13	fimD	outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis

GCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGT  >  W3110S.gb/4551953‑4552014 |                                                              gcAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGt  <  1:1108329/62‑1 (MQ=255) gcAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGt  <  1:118799/62‑1 (MQ=255) gcAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGt  <  1:1509492/62‑1 (MQ=255) gcAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGt  <  1:178497/62‑1 (MQ=255) gcAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGt  <  1:1871082/62‑1 (MQ=255) gcAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGt  <  1:2073180/62‑1 (MQ=255) gcAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGt  <  1:2576302/62‑1 (MQ=255) gcAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGt  <  1:2593158/62‑1 (MQ=255) gcAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGt  <  1:2633212/62‑1 (MQ=255) gcAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGt  <  1:2771113/62‑1 (MQ=255) gcAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGt  <  1:536771/62‑1 (MQ=255) gcAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGt  <  1:654684/62‑1 (MQ=255) gcAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGt  <  1:976332/62‑1 (MQ=255) |                                                              GCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGT  >  W3110S.gb/4551953‑4552014

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑