Missing coverage evidence...
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TTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGCC  >  W3110S.gb/4565379‑4565440 |                                                              ttttttTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:2376102/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGTAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:765588/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:2905440/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:2542850/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:2543392/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:2550660/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:2620825/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:271581/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:2774017/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:2838597/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:919832/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:401291/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:507494/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:523984/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:52753/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:773409/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:77727/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:1187468/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:1699067/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:1234002/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:1284709/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:1471895/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:151571/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:15657/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:1570671/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:1631429/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:2297022/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:1712049/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:1715442/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:1717566/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:1793240/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:1913980/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:2234225/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:2295998/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGCTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:741453/62‑1 (MQ=255) |                                                              TTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGCC  >  W3110S.gb/4565379‑4565440

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑