Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4565985	4565991	7	29 [0]	[0] 58	kptA	2'‑phosphotransferase

CGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCAA  >  W3110S.gb/4565992‑4566038 |                                               cGTTCATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:2579021/47‑1 (MQ=255) cGTACATGTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:1130334/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTTATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:1523514/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:371204/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:2217088/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:2244509/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:2302580/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:2424247/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:2535380/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:1060327/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:2615072/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:2646555/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:2652253/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:2819434/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:349494/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:363552/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:366084/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:929223/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:93928/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:379029/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:379390/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:397751/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:401959/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:459863/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:485505/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:503669/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:588945/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:590632/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:82342/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:834311/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:1625702/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:1139246/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:115399/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:1167151/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:1200784/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:1225368/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:1231288/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:12592/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:1259740/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:1331216/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:1362968/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:138679/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:1418264/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:143324/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:218099/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:1643845/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:1701753/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:1808716/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:1827409/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:1924699/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:1976298/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:1985676/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:1996122/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:2006788/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:2014030/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:2022334/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:2168428/47‑1 (MQ=255) cGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCaa  <  1:2171277/47‑1 (MQ=255) |                                               CGTACATCTCTCTGCTGATGAAGCAACGGCACGCAAAGTGGGAGCAA  >  W3110S.gb/4565992‑4566038

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑