Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	248137	248139	3	29 [0]	[0] 24	yafM/fhiA	conserved hypothetical protein/ECK0230:JW5811:b0229; flagellar system protein, promoterless fragment

CGCAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGG  >  W3110S.gb/248140‑248200 |                                                             cgcAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCTTGTGCCGGATCgg  <  1:2765279/61‑1 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCgg  <  1:2658593/61‑1 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCgg  <  1:893106/61‑1 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCgg  <  1:890091/61‑1 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCgg  <  1:752924/61‑1 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCgg  <  1:74730/61‑1 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCgg  <  1:698003/61‑1 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCgg  <  1:669610/61‑1 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCgg  <  1:577407/61‑1 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCgg  <  1:479660/61‑1 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCgg  <  1:449337/61‑1 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCgg  <  1:38757/61‑1 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCgg  <  1:100542/61‑1 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCgg  <  1:256527/61‑1 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCgg  <  1:2536932/61‑1 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCgg  <  1:2517624/61‑1 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCgg  <  1:2332763/61‑1 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCgg  <  1:2161693/61‑1 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCgg  <  1:2003709/61‑1 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCgg  <  1:1559528/61‑1 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCgg  <  1:1416146/61‑1 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCgg  <  1:1272161/61‑1 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCgg  <  1:1180697/61‑1 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCgg  <  1:1025498/61‑1 (MQ=255) |                                                             CGCAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGG  >  W3110S.gb/248140‑248200

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑