Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4574509	4574547	39	15 [1]	[0] 30	yjiQ	predicted transposase

CATTAAGGCAGCCCTTGCCTGAGCGTGAGCGCTATTCATGGCTC  >  W3110S.gb/4574548‑4574591 |                                            cATTAAGGCAGCCCTTGCCTGAGCGTGAGCGCTATTCATGGCTc  <  1:2415443/44‑1 (MQ=255) cATTAAGGCAGCCCTTGCCTGAGCGTGAGCGCTATTCATGGCTc  <  1:832563/44‑1 (MQ=255) cATTAAGGCAGCCCTTGCCTGAGCGTGAGCGCTATTCATGGCTc  <  1:742337/44‑1 (MQ=255) cATTAAGGCAGCCCTTGCCTGAGCGTGAGCGCTATTCATGGCTc  <  1:728422/44‑1 (MQ=255) cATTAAGGCAGCCCTTGCCTGAGCGTGAGCGCTATTCATGGCTc  <  1:672156/44‑1 (MQ=255) cATTAAGGCAGCCCTTGCCTGAGCGTGAGCGCTATTCATGGCTc  <  1:651730/44‑1 (MQ=255) cATTAAGGCAGCCCTTGCCTGAGCGTGAGCGCTATTCATGGCTc  <  1:510402/44‑1 (MQ=255) cATTAAGGCAGCCCTTGCCTGAGCGTGAGCGCTATTCATGGCTc  <  1:2924377/44‑1 (MQ=255) cATTAAGGCAGCCCTTGCCTGAGCGTGAGCGCTATTCATGGCTc  <  1:2900170/44‑1 (MQ=255) cATTAAGGCAGCCCTTGCCTGAGCGTGAGCGCTATTCATGGCTc  <  1:2895744/44‑1 (MQ=255) cATTAAGGCAGCCCTTGCCTGAGCGTGAGCGCTATTCATGGCTc  <  1:2890896/44‑1 (MQ=255) cATTAAGGCAGCCCTTGCCTGAGCGTGAGCGCTATTCATGGCTc  <  1:2871567/44‑1 (MQ=255) cATTAAGGCAGCCCTTGCCTGAGCGTGAGCGCTATTCATGGCTc  <  1:2850444/44‑1 (MQ=255) cATTAAGGCAGCCCTTGCCTGAGCGTGAGCGCTATTCATGGCTc  <  1:2849831/44‑1 (MQ=255) cATTAAGGCAGCCCTTGCCTGAGCGTGAGCGCTATTCATGGCTc  <  1:2539309/44‑1 (MQ=255) cATTAAGGCAGCCCTTGCCTGAGCGTGAGCGCTATTCATGGCTc  <  1:1031097/44‑1 (MQ=255) cATTAAGGCAGCCCTTGCCTGAGCGTGAGCGCTATTCATGGCTc  <  1:2275813/44‑1 (MQ=255) cATTAAGGCAGCCCTTGCCTGAGCGTGAGCGCTATTCATGGCTc  <  1:2259496/44‑1 (MQ=255) cATTAAGGCAGCCCTTGCCTGAGCGTGAGCGCTATTCATGGCTc  <  1:2212675/44‑1 (MQ=255) cATTAAGGCAGCCCTTGCCTGAGCGTGAGCGCTATTCATGGCTc  <  1:217455/44‑1 (MQ=255) cATTAAGGCAGCCCTTGCCTGAGCGTGAGCGCTATTCATGGCTc  <  1:2148360/44‑1 (MQ=255) cATTAAGGCAGCCCTTGCCTGAGCGTGAGCGCTATTCATGGCTc  <  1:2086898/44‑1 (MQ=255) cATTAAGGCAGCCCTTGCCTGAGCGTGAGCGCTATTCATGGCTc  <  1:2014140/44‑1 (MQ=255) cATTAAGGCAGCCCTTGCCTGAGCGTGAGCGCTATTCATGGCTc  <  1:1979318/44‑1 (MQ=255) cATTAAGGCAGCCCTTGCCTGAGCGTGAGCGCTATTCATGGCTc  <  1:1710849/44‑1 (MQ=255) cATTAAGGCAGCCCTTGCCTGAGCGTGAGCGCTATTCATGGCTc  <  1:1555489/44‑1 (MQ=255) cATTAAGGCAGCCCTTGCCTGAGCGTGAGCGCTATTCATGGCTc  <  1:1478731/44‑1 (MQ=255) cATTAAGGCAGCCCTTGCCTGAGCGTGAGCGCTATTCATGGCTc  <  1:1347656/44‑1 (MQ=255) cATTAAGGCAGCCCTTGCCTGAGCGTGAGCGCTATTCATGGCTc  <  1:1289010/44‑1 (MQ=255) cATTAAGGCAGCCCTTGCCTGAGCGTGAGCGCTATTCATGGCTc  <  1:1237100/44‑1 (MQ=255) |                                            CATTAAGGCAGCCCTTGCCTGAGCGTGAGCGCTATTCATGGCTC  >  W3110S.gb/4574548‑4574591

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑