Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4581422	4581445	24	9 [0]	[0] 47	yjiV	ECK4334:JW5954:b4486; conserved hypothetical protein

TCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGCC  >  W3110S.gb/4581446‑4581483 |                                      tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAGTGTCGcc  >  1:42516/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:2720240/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:2018244/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:2038279/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:2054736/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:2168378/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:2259044/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:2343753/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:2373532/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:2426739/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:2575885/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:2608575/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:26112/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:1961847/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:274511/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:2822204/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:28513/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:338636/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:39109/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:392191/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:396500/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:548413/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:664591/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:1591370/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:1066611/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:1071047/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:1084098/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:1138597/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:1186182/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:1188053/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:1199719/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:1266038/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:1299929/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:1386323/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:1388453/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:1000955/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:1593682/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:159808/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:1633768/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:1638694/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:1751435/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:1848243/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:1860489/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:1896440/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:1950496/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGcc  >  1:1950838/1‑38 (MQ=255) tCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGc   >  1:2008779/1‑37 (MQ=255) |                                      TCAAAATGGCTCAGGCCTGCAAGGAAGGGAATGTCGCC  >  W3110S.gb/4581446‑4581483

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑