Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	249162	249175	14	20 [0]	[0] 10	fhiA	ECK0230:JW5811:b0229; flagellar system protein, promoterless fragment

CCTTTATGCCGTTGATGAAAATGGCGTACTGACTGGGCTTAAGGCGGAAGTTTTCCCGAAT  >  W3110S.gb/249176‑249236 |                                                             ccTTTATGCCGTTGATGAAAATGGCGTACTGACTGGGCTTAAGGCGGAAGTTTTCCCGAAt  <  1:1063414/61‑1 (MQ=255) ccTTTATGCCGTTGATGAAAATGGCGTACTGACTGGGCTTAAGGCGGAAGTTTTCCCGAAt  <  1:1232311/61‑1 (MQ=255) ccTTTATGCCGTTGATGAAAATGGCGTACTGACTGGGCTTAAGGCGGAAGTTTTCCCGAAt  <  1:1261513/61‑1 (MQ=255) ccTTTATGCCGTTGATGAAAATGGCGTACTGACTGGGCTTAAGGCGGAAGTTTTCCCGAAt  <  1:1334886/61‑1 (MQ=255) ccTTTATGCCGTTGATGAAAATGGCGTACTGACTGGGCTTAAGGCGGAAGTTTTCCCGAAt  <  1:137030/61‑1 (MQ=255) ccTTTATGCCGTTGATGAAAATGGCGTACTGACTGGGCTTAAGGCGGAAGTTTTCCCGAAt  <  1:1488160/61‑1 (MQ=255) ccTTTATGCCGTTGATGAAAATGGCGTACTGACTGGGCTTAAGGCGGAAGTTTTCCCGAAt  <  1:1491500/61‑1 (MQ=255) ccTTTATGCCGTTGATGAAAATGGCGTACTGACTGGGCTTAAGGCGGAAGTTTTCCCGAAt  <  1:2000678/61‑1 (MQ=255) ccTTTATGCCGTTGATGAAAATGGCGTACTGACTGGGCTTAAGGCGGAAGTTTTCCCGAAt  <  1:2423186/61‑1 (MQ=255) ccTTTATGCCGTTGATGAAAATGGCGTACTGACTGGGCTTAAGGCGGAAGTTTTCCCGAAt  <  1:2845552/61‑1 (MQ=255) |                                                             CCTTTATGCCGTTGATGAAAATGGCGTACTGACTGGGCTTAAGGCGGAAGTTTTCCCGAAT  >  W3110S.gb/249176‑249236

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑