Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	259057	259065	9	20 [0]	[0] 10	phoE	outer membrane phosphoporin protein E

CTGCTTTATTACCGGCAAACTCTGCTTCCCAACGACCATAACCAGTCAGTTGATCGTTAATT  >  W3110S.gb/259066‑259127 |                                                              ctGCTTTATTACCGGCAAACTCTGCTTCCCAACGACCATAACCAGTCAGTTGATCGTTAAtt  >  1:1085507/1‑62 (MQ=255) ctGCTTTATTACCGGCAAACTCTGCTTCCCAACGACCATAACCAGTCAGTTGATCGTTAAtt  >  1:1738134/1‑62 (MQ=255) ctGCTTTATTACCGGCAAACTCTGCTTCCCAACGACCATAACCAGTCAGTTGATCGTTAAtt  >  1:2145689/1‑62 (MQ=255) ctGCTTTATTACCGGCAAACTCTGCTTCCCAACGACCATAACCAGTCAGTTGATCGTTAAtt  >  1:2255427/1‑62 (MQ=255) ctGCTTTATTACCGGCAAACTCTGCTTCCCAACGACCATAACCAGTCAGTTGATCGTTAAtt  >  1:2344795/1‑62 (MQ=255) ctGCTTTATTACCGGCAAACTCTGCTTCCCAACGACCATAACCAGTCAGTTGATCGTTAAtt  >  1:2491648/1‑62 (MQ=255) ctGCTTTATTACCGGCAAACTCTGCTTCCCAACGACCATAACCAGTCAGTTGATCGTTAAtt  >  1:2527746/1‑62 (MQ=255) ctGCTTTATTACCGGCAAACTCTGCTTCCCAACGACCATAACCAGTCAGTTGATCGTTAAtt  >  1:686112/1‑62 (MQ=255) ctGCTTTATTACCGGCAAACTCTGCTTCCCAACGACCATAACCAGTCAGTTGATCGTTAAtt  >  1:959322/1‑62 (MQ=255) ctGCTTTATTACCGGCAAACTCTGCTTCCAAACGACCATAACcagtc                 >  1:605114/1‑47 (MQ=255) |                                                              CTGCTTTATTACCGGCAAACTCTGCTTCCCAACGACCATAACCAGTCAGTTGATCGTTAATT  >  W3110S.gb/259066‑259127

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑