Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	295418	295441	24	16 [0]	[0] 26	intF	predicted phage integrase

TGCAATAGGATTATTGAGGCTACGCACGGCACTAAACCAGCTTTTTAGTTGTTCCTTTTGCA  >  W3110S.gb/295442‑295503 |                                                              tGCAATAGGATTATTGAGGCTACGCACGGCACTAAAcc                          >  1:1182555/1‑38 (MQ=255) tGCAATAGGATTATTGAGGCTACGCACGGCACTAAACCAGCtt                     >  1:1339355/1‑43 (MQ=255) tGCAATAGGATTATTGAGGCTACGCACGGCACTAAACCAGCTTTTTAGTTGTTCCTTTTGc   >  1:835658/1‑61 (MQ=255) tGCAATAGGATTATTGAGGCTACGCACGGCACTAAACCAGCTTTTTAGTTGTTCCTTTTGc   >  1:756482/1‑61 (MQ=255) tGCAATAGGATTATTGAGGCTACGCACGGCACTAAACCAGCTTTTTAGTTGTTCCTTTTGCa  >  1:2451368/1‑62 (MQ=255) tGCAATAGGATTATTGAGGCTACGCACGGCACTAAACCAGCTTTTTAGTTGTTCCTTTTGCa  >  1:90018/1‑62 (MQ=255) tGCAATAGGATTATTGAGGCTACGCACGGCACTAAACCAGCTTTTTAGTTGTTCCTTTTGCa  >  1:874410/1‑62 (MQ=255) tGCAATAGGATTATTGAGGCTACGCACGGCACTAAACCAGCTTTTTAGTTGTTCCTTTTGCa  >  1:661527/1‑62 (MQ=255) tGCAATAGGATTATTGAGGCTACGCACGGCACTAAACCAGCTTTTTAGTTGTTCCTTTTGCa  >  1:444339/1‑62 (MQ=255) tGCAATAGGATTATTGAGGCTACGCACGGCACTAAACCAGCTTTTTAGTTGTTCCTTTTGCa  >  1:2921649/1‑62 (MQ=255) tGCAATAGGATTATTGAGGCTACGCACGGCACTAAACCAGCTTTTTAGTTGTTCCTTTTGCa  >  1:2802133/1‑62 (MQ=255) tGCAATAGGATTATTGAGGCTACGCACGGCACTAAACCAGCTTTTTAGTTGTTCCTTTTGCa  >  1:2625668/1‑62 (MQ=255) tGCAATAGGATTATTGAGGCTACGCACGGCACTAAACCAGCTTTTTAGTTGTTCCTTTTGCa  >  1:2575783/1‑62 (MQ=255) tGCAATAGGATTATTGAGGCTACGCACGGCACTAAACCAGCTTTTTAGTTGTTCCTTTTGCa  >  1:2550512/1‑62 (MQ=255) tGCAATAGGATTATTGAGGCTACGCACGGCACTAAACCAGCTTTTTAGTTGTTCCTTTTGCa  >  1:2502189/1‑62 (MQ=255) tGCAATAGGATTATTGAGGCTACGCACGGCACTAAACCAGCTTTTTAGTTGTTCCTTTTGCa  >  1:2230/1‑62 (MQ=255) tGCAATAGGATTATTGAGGCTACGCACGGCACTAAACCAGCTTTTTAGTTGTTCCTTTTGCa  >  1:2075011/1‑62 (MQ=255) tGCAATAGGATTATTGAGGCTACGCACGGCACTAAACCAGCTTTTTAGTTGTTCCTTTTGCa  >  1:199490/1‑62 (MQ=255) tGCAATAGGATTATTGAGGCTACGCACGGCACTAAACCAGCTTTTTAGTTGTTCCTTTTGCa  >  1:1937455/1‑62 (MQ=255) tGCAATAGGATTATTGAGGCTACGCACGGCACTAAACCAGCTTTTTAGTTGTTCCTTTTGCa  >  1:1918828/1‑62 (MQ=255) tGCAATAGGATTATTGAGGCTACGCACGGCACTAAACCAGCTTTTTAGTTGTTCCTTTTGCa  >  1:181000/1‑62 (MQ=255) tGCAATAGGATTATTGAGGCTACGCACGGCACTAAACCAGCTTTTTAGTTGTTCCTTTTGCa  >  1:1668664/1‑62 (MQ=255) tGCAATAGGATTATTGAGGCTACGCACGGCACTAAACCAGCTTTTTAGTTGTTCCTTTTGCa  >  1:1491090/1‑62 (MQ=255) tGCAATAGGATTATTGAGGCTACGCACGGCACTAAACCAGCTTTTTAGTTGTTCCTTTTGCa  >  1:139012/1‑62 (MQ=255) tGCAATAGGATTATTGAGGCTACGCACGGCACTAAACCAGCTTTTTAGTTGTTCCTTTTGCa  >  1:1389172/1‑62 (MQ=255) tGCAATAGGATTATTGAGGCTACGCACGGCACTAAACCAGCTTTTTAGTTGTTCCTTTTGCa  >  1:1237479/1‑62 (MQ=255) |                                                              TGCAATAGGATTATTGAGGCTACGCACGGCACTAAACCAGCTTTTTAGTTGTTCCTTTTGCA  >  W3110S.gb/295442‑295503

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑