Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	399799	399842	44	19 [0]	[0] 43	ddlA	D‑alanine‑D‑alanine ligase A

ATGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGTTT  >  W3110S.gb/399843‑399904 |                                                              aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGt                        >  1:1291387/1‑40 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGcag              >  1:1228107/1‑48 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGa             >  1:859966/1‑51 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGc          >  1:1962188/1‑54 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:2349158/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:984485/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:2384512/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:2423800/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:2427083/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:245499/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:2603653/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:2625882/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:2637062/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:2737884/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:2907184/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:294096/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:397195/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:587385/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:700765/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:751099/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:903071/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:927081/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:1575748/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:1296025/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:1306687/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:1312932/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:1414753/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:146228/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:1506224/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:1514225/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:1554615/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:2312466/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:1581937/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:1591625/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:1824828/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:2023979/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:209397/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:2117539/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:2237482/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:2244675/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGttt  >  1:2267786/1‑62 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGtt   >  1:1391546/1‑61 (MQ=255) aTGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGt    >  1:405590/1‑60 (MQ=255) |                                                              ATGACATCCACCGTCGGCAACGGCTGACCGTTTTGCGCGTCGATAAGCTGATGCTCATGTTT  >  W3110S.gb/399843‑399904

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑