Missing coverage evidence...
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TTACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGC  >  W3110S.gb/472348‑472394 |                                               ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:457907/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:2640097/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:2705328/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:2761210/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:2793964/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:2832571/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:326748/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:370111/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:381463/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:381917/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:2625021/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:504941/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:615506/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:624299/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:684/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:684202/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:732223/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:950102/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:977435/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:1729718/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:123188/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:1242107/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:1269950/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:1313931/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:1361501/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:1389348/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:1504295/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:1512085/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:1024638/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:1756862/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:192171/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:1975443/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:2078472/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:2084815/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:2128701/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:2260708/47‑1 (MQ=255) ttACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGc  <  1:2401129/47‑1 (MQ=255) |                                               TTACGGTGGGTTGATTCGCGGCAAAAACGTGCTGTCGATGCTGACGC  >  W3110S.gb/472348‑472394

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑