Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	573405	573481	77	9 [0]	[0] 47	ybcQ	predicted antitermination protein

GCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGT  >  W3110S.gb/573482‑573543 |                                                              gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:2902944/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:2402468/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:2473842/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:2483048/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:2505736/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:2511499/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:2631087/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:2846608/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:2857834/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:2876721/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:2879101/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:2900458/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:2322288/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:301435/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:366168/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:380715/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:48952/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:498131/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:510425/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:663731/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:736253/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:8179/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:99828/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:1852048/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:1046736/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:1078728/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:1164879/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:1243364/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:1283107/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:1314120/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:1395403/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:158798/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:1602291/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:1621846/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:1718407/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:1017214/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:1867894/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:1901542/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:1982403/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:203506/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:2047898/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:2052358/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:2125723/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:2186973/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:219685/62‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:230247/62‑1 (MQ=255) gCTGAGCGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgt  <  1:2741701/62‑1 (MQ=255) |                                                              GCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGT  >  W3110S.gb/573482‑573543

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑