Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	576542	576582	41	18 [0]	[0] 13	nmpC/essD	DLP12 prophage region; ECK0544:JW5078:b0553; truncated outer membrane porin/predicted phage lysis protein

CCCTCAATTTACACCCGCTTTGTCTGCGAGGTGGGGTTA  >  W3110S.gb/576583‑576621 |                                       cccTCAATTTACACCCGCTTTGTCTGCGAGGTGGGGTTa  <  1:1500972/39‑1 (MQ=255) cccTCAATTTACACCCGCTTTGTCTGCGAGGTGGGGTTa  <  1:1504446/39‑1 (MQ=255) cccTCAATTTACACCCGCTTTGTCTGCGAGGTGGGGTTa  <  1:1557160/39‑1 (MQ=255) cccTCAATTTACACCCGCTTTGTCTGCGAGGTGGGGTTa  <  1:1802040/39‑1 (MQ=255) cccTCAATTTACACCCGCTTTGTCTGCGAGGTGGGGTTa  <  1:1850664/39‑1 (MQ=255) cccTCAATTTACACCCGCTTTGTCTGCGAGGTGGGGTTa  <  1:1971053/39‑1 (MQ=255) cccTCAATTTACACCCGCTTTGTCTGCGAGGTGGGGTTa  <  1:1976743/39‑1 (MQ=255) cccTCAATTTACACCCGCTTTGTCTGCGAGGTGGGGTTa  <  1:1987853/39‑1 (MQ=255) cccTCAATTTACACCCGCTTTGTCTGCGAGGTGGGGTTa  <  1:2506995/39‑1 (MQ=255) cccTCAATTTACACCCGCTTTGTCTGCGAGGTGGGGTTa  <  1:2530792/39‑1 (MQ=255) cccTCAATTTACACCCGCTTTGTCTGCGAGGTGGGGTTa  <  1:359926/39‑1 (MQ=255) cccTCAATTTACACCCGCTTTGTCTGCGAGGTGGGGTTa  <  1:609068/39‑1 (MQ=255) cccTCAATTTACACCCGCTTTGTCTGCGAGGTGGGGTTa  <  1:848267/39‑1 (MQ=255) |                                       CCCTCAATTTACACCCGCTTTGTCTGCGAGGTGGGGTTA  >  W3110S.gb/576583‑576621

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑