Missing coverage evidence...
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GCTGGTTGCCGCAGGACAGTTTGCTGTTACATCTGTGTGGGAAAAGAACGCTGAGATTTGTG  >  W3110S.gb/658455‑658516 |                                                              gCTGGTTGCCGCAGGACAGTTTGCTGTTACATCTGTGTGGGAAAAGAACGCTGAGATTtgtg  <  1:2284663/62‑1 (MQ=255) gCTGGTTGCCGCAGGACAGTTTGCTGTTACATCTGTGTGGGAAAAGAACGCTGAGATTtgtg  <  1:902186/62‑1 (MQ=255) gCTGGTTGCCGCAGGACAGTTTGCTGTTACATCTGTGTGGGAAAAGAACGCTGAGATTtgtg  <  1:815347/62‑1 (MQ=255) gCTGGTTGCCGCAGGACAGTTTGCTGTTACATCTGTGTGGGAAAAGAACGCTGAGATTtgtg  <  1:809578/62‑1 (MQ=255) gCTGGTTGCCGCAGGACAGTTTGCTGTTACATCTGTGTGGGAAAAGAACGCTGAGATTtgtg  <  1:791888/62‑1 (MQ=255) gCTGGTTGCCGCAGGACAGTTTGCTGTTACATCTGTGTGGGAAAAGAACGCTGAGATTtgtg  <  1:695896/62‑1 (MQ=255) gCTGGTTGCCGCAGGACAGTTTGCTGTTACATCTGTGTGGGAAAAGAACGCTGAGATTtgtg  <  1:660389/62‑1 (MQ=255) gCTGGTTGCCGCAGGACAGTTTGCTGTTACATCTGTGTGGGAAAAGAACGCTGAGATTtgtg  <  1:428971/62‑1 (MQ=255) gCTGGTTGCCGCAGGACAGTTTGCTGTTACATCTGTGTGGGAAAAGAACGCTGAGATTtgtg  <  1:356399/62‑1 (MQ=255) gCTGGTTGCCGCAGGACAGTTTGCTGTTACATCTGTGTGGGAAAAGAACGCTGAGATTtgtg  <  1:345704/62‑1 (MQ=255) gCTGGTTGCCGCAGGACAGTTTGCTGTTACATCTGTGTGGGAAAAGAACGCTGAGATTtgtg  <  1:291073/62‑1 (MQ=255) gCTGGTTGCCGCAGGACAGTTTGCTGTTACATCTGTGTGGGAAAAGAACGCTGAGATTtgtg  <  1:283731/62‑1 (MQ=255) gCTGGTTGCCGCAGGACAGTTTGCTGTTACATCTGTGTGGGAAAAGAACGCTGAGATTtgtg  <  1:2627580/62‑1 (MQ=255) gCTGGTTGCCGCAGGACAGTTTGCTGTTACATCTGTGTGGGAAAAGAACGCTGAGATTtgtg  <  1:240336/62‑1 (MQ=255) gCTGGTTGCCGCAGGACAGTTTGCTGTTACATCTGTGTGGGAAAAGAACGCTGAGATTtgtg  <  1:2311878/62‑1 (MQ=255) gCTGGTTGCCGCAGGACAGTTTGCTGTTACATCTGTGTGGGAAAAGAACGCTGAGATTtgtg  <  1:1003025/62‑1 (MQ=255) gCTGGTTGCCGCAGGACAGTTTGCTGTTACATCTGTGTGGGAAAAGAACGCTGAGATTtgtg  <  1:2260053/62‑1 (MQ=255) gCTGGTTGCCGCAGGACAGTTTGCTGTTACATCTGTGTGGGAAAAGAACGCTGAGATTtgtg  <  1:223651/62‑1 (MQ=255) gCTGGTTGCCGCAGGACAGTTTGCTGTTACATCTGTGTGGGAAAAGAACGCTGAGATTtgtg  <  1:2199825/62‑1 (MQ=255) gCTGGTTGCCGCAGGACAGTTTGCTGTTACATCTGTGTGGGAAAAGAACGCTGAGATTtgtg  <  1:1984875/62‑1 (MQ=255) gCTGGTTGCCGCAGGACAGTTTGCTGTTACATCTGTGTGGGAAAAGAACGCTGAGATTtgtg  <  1:1726410/62‑1 (MQ=255) gCTGGTTGCCGCAGGACAGTTTGCTGTTACATCTGTGTGGGAAAAGAACGCTGAGATTtgtg  <  1:1584910/62‑1 (MQ=255) gCTGGTTGCCGCAGGACAGTTTGCTGTTACATCTGTGTGGGAAAAGAACGCTGAGATTtgtg  <  1:1466941/62‑1 (MQ=255) gCTGGTTGCCGCAGGACAGTTTGCTGTTACATCTGTGTGGGAAAAGAACGCTGAGATTtgtg  <  1:1451141/62‑1 (MQ=255) gCTGGTTGCCGCAGGACAGTTTGCTGTTACATCTGTGTGGGAAAAGAACGCTGAGATTtgtg  <  1:14383/62‑1 (MQ=255) gCTGGTTGCCGCAGGACAGTTTGCTGTTACATCTGTGTGGGAAAAGAACGCTGAGATTtgtg  <  1:1384473/62‑1 (MQ=255) gCTGGTTGCCGCAGGACAGTTTGCTGTTACATCTGTGTGGGAAAAGAACGCTGAGATTtgtg  <  1:130553/62‑1 (MQ=255) gCTGGTTGCCGCAGGACAGTTTGCTGTTACATCTGTGTGGGAAAAGAACGCTGAGATTtgtg  <  1:1237016/62‑1 (MQ=255) gCTGGTTGCCGCAGGACAGTTTGCTGTTACATCTGTGTGGGAAAAGAACGCTGAGATTtgtg  <  1:1024448/62‑1 (MQ=255) gCTGGTTGCCGCAGGACAGTTTGCTGTTACATCTGTGTGGGAAAAGAACGCTGAGATTtgtg  <  1:1012975/62‑1 (MQ=255) |                                                              GCTGGTTGCCGCAGGACAGTTTGCTGTTACATCTGTGTGGGAAAAGAACGCTGAGATTTGTG  >  W3110S.gb/658455‑658516

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑