Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1012739	1012774	36	11 [0]	[0] 9	pqiA	paraquat‑inducible membrane protein A

TTCTGTTACTGGTGAATCGCGCGGAATTACCGGTCCGTTTAAAAGAGCAACTGGCACGGGTG  >  W3110S.gb/1012775‑1012836 |                                                              ttCTGTTACTGGTGAATCGCGCGGAATTACCGGTCCGTTTAAAAGAGCAACTGGCACGGGTg  <  1:1349966/62‑1 (MQ=255) ttCTGTTACTGGTGAATCGCGCGGAATTACCGGTCCGTTTAAAAGAGCAACTGGCACGGGTg  <  1:1779140/62‑1 (MQ=255) ttCTGTTACTGGTGAATCGCGCGGAATTACCGGTCCGTTTAAAAGAGCAACTGGCACGGGTg  <  1:1823745/62‑1 (MQ=255) ttCTGTTACTGGTGAATCGCGCGGAATTACCGGTCCGTTTAAAAGAGCAACTGGCACGGGTg  <  1:1970126/62‑1 (MQ=255) ttCTGTTACTGGTGAATCGCGCGGAATTACCGGTCCGTTTAAAAGAGCAACTGGCACGGGTg  <  1:2096920/62‑1 (MQ=255) ttCTGTTACTGGTGAATCGCGCGGAATTACCGGTCCGTTTAAAAGAGCAACTGGCACGGGTg  <  1:2162217/62‑1 (MQ=255) ttCTGTTACTGGTGAATCGCGCGGAATTACCGGTCCGTTTAAAAGAGCAACTGGCACGGGTg  <  1:230732/62‑1 (MQ=255) ttCTGTTACTGGTGAATCGCGCGGAATTACCGGTCCGTTTAAAAGAGCAACTGGCACGGGTg  <  1:2358753/62‑1 (MQ=255) ttCTGTTACTGGTGAATCGCGCGGAATTACCGGTCCGTTTAAAAGAGCAACTGGCACGGGTg  <  1:378593/62‑1 (MQ=255) |                                                              TTCTGTTACTGGTGAATCGCGCGGAATTACCGGTCCGTTTAAAAGAGCAACTGGCACGGGTG  >  W3110S.gb/1012775‑1012836

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑