Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	1039837	1039867	31	4 [1]	[0] 40	appB	cytochrome bd‑II oxidase, subunit II

AACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTT  >  W3110S.gb/1039868‑1039908 |                                         aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:2732421/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:1016898/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:2338834/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:2390845/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:2479408/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:2525544/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:2623268/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:2674435/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:2697806/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:2722119/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:2323635/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:2764876/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:2768322/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:2841448/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:31669/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:432912/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:545766/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:712303/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:741962/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:949298/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:1919873/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:1053236/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:1073684/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:130437/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:1328403/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:1377284/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:1428386/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:147057/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:1530157/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:1725358/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:2305720/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:1926945/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:1938717/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:1972768/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:2041373/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:2101146/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:2102677/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:2211446/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:221507/41‑1 (MQ=255) aaCAGCGTTGGGGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGtt  <  1:2702163/41‑1 (MQ=255) |                                         AACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTT  >  W3110S.gb/1039868‑1039908

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑