Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1041352	1041354	3	8 [0]	[0] 13	appA	phosphoanhydride phosphorylase

CGATTATTGCTGATGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCT  >  W3110S.gb/1041355‑1041415 |                                                             cgATTATTGCTGATGTCGACGCGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCt  >  1:913676/1‑61 (MQ=255) cgATTATTGCTGATGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCt  >  1:1052021/1‑61 (MQ=255) cgATTATTGCTGATGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCt  >  1:1133550/1‑61 (MQ=255) cgATTATTGCTGATGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCt  >  1:2044150/1‑61 (MQ=255) cgATTATTGCTGATGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCt  >  1:2396446/1‑61 (MQ=255) cgATTATTGCTGATGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCt  >  1:2405941/1‑61 (MQ=255) cgATTATTGCTGATGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCt  >  1:2487299/1‑61 (MQ=255) cgATTATTGCTGATGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCt  >  1:2708030/1‑61 (MQ=255) cgATTATTGCTGATGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCt  >  1:2758710/1‑61 (MQ=255) cgATTATTGCTGATGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCt  >  1:2827712/1‑61 (MQ=255) cgATTATTGCTGATGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCt  >  1:495707/1‑61 (MQ=255) cgATTATTGCTGATGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCt  >  1:673054/1‑61 (MQ=255) cgATTATTGCTGATGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCt  >  1:815190/1‑61 (MQ=255) |                                                             CGATTATTGCTGATGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCT  >  W3110S.gb/1041355‑1041415

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑