Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1088417	1088437	21	24 [0]	[0] 28	ycdR	predicted enzyme associated with biofilm formation

CTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAA  >  W3110S.gb/1088438‑1088499 |                                                              cTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGt                          >  1:1383843/1‑38 (MQ=255) cTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTaa  >  1:2463226/1‑62 (MQ=255) cTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTaa  >  1:981924/1‑62 (MQ=255) cTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTaa  >  1:978542/1‑62 (MQ=255) cTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTaa  >  1:967524/1‑62 (MQ=255) cTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTaa  >  1:835065/1‑62 (MQ=255) cTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTaa  >  1:495891/1‑62 (MQ=255) cTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTaa  >  1:2889339/1‑62 (MQ=255) cTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTaa  >  1:2786832/1‑62 (MQ=255) cTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTaa  >  1:2719677/1‑62 (MQ=255) cTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTaa  >  1:2527595/1‑62 (MQ=255) cTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTaa  >  1:2484836/1‑62 (MQ=255) cTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTaa  >  1:2402540/1‑62 (MQ=255) cTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTaa  >  1:214082/1‑62 (MQ=255) cTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTaa  >  1:2050929/1‑62 (MQ=255) cTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTaa  >  1:1669697/1‑62 (MQ=255) cTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTaa  >  1:1584274/1‑62 (MQ=255) cTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTaa  >  1:1549992/1‑62 (MQ=255) cTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTaa  >  1:1546345/1‑62 (MQ=255) cTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTaa  >  1:1331996/1‑62 (MQ=255) cTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTaa  >  1:1284186/1‑62 (MQ=255) cTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTaa  >  1:1244591/1‑62 (MQ=255) cTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTaa  >  1:1195404/1‑62 (MQ=255) cTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTaa  >  1:1192918/1‑62 (MQ=255) cTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTa   >  1:46276/1‑61 (MQ=255) cTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTa   >  1:73353/1‑61 (MQ=255) cTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTATTaa  >  1:966149/1‑62 (MQ=255) cTGCCAGTTTTGTGCCTGAAATTATAAAATAGAtt                             >  1:1121005/1‑35 (MQ=37) |                                                              CTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAA  >  W3110S.gb/1088438‑1088499

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑