Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1100192	1100294	103	40 [0]	[0] 37	ycdY	conserved hypothetical protein

TATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACCACGCCTTT  >  W3110S.gb/1100295‑1100356 |                                                              tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:2790801/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:233614/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:2381113/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:2502769/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:2552549/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:255482/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:2681476/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:2709738/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:2724765/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:2253378/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:2808175/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:2841849/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:351609/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:431410/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:611767/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:680912/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:718218/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:801332/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:1631916/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:1077275/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:125223/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:1297011/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:1305129/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:1309955/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:1338893/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:135108/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:1375771/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:1523773/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:1057406/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:1723146/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:1785483/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:1948303/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:1954608/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:196213/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:2047107/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:2165251/62‑1 (MQ=255) tATCTGTTACCCTGGTGTGGTGAGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACTACGCCttt  <  1:2414852/62‑1 (MQ=255) |                                                              TATCTGTTACCCTGGTGTGGTGCGTTCCTTGGCAAAGTGGAGGCCCATGCAACCACGCCTTT  >  W3110S.gb/1100295‑1100356

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑