Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1138471	1138578	108	53 [0]	[0] 31	flgI	predicted flagellar basal body protein

GGTTAATGTCACCCCGCAGGACGCTAAAGTAGTGATTAACTCGCGCACCGGTTCGGTGGTG  >  W3110S.gb/1138579‑1138639 |                                                             ggTTAATGTCACCCCGCAGGACGCTAAAGTAGTGATTAACTCgcgc                 >  1:687935/1‑46 (MQ=255) ggTTAATGTCACCCCGCAGGACGCTAAAGTAGTGATTAACTCGCGCACCg             >  1:1445656/1‑50 (MQ=255) ggTTAATGTCACCCCGCAGGACGCTAAAGTAGTGATTAACTCGCGCACCGGTTCggtggt   >  1:1781295/1‑60 (MQ=255) ggTTAATGTCACCCCGCAGGACGCTAAAGTAGTGATTAACTCGCGCACCGGTTCGgtggtg  >  1:2398693/1‑61 (MQ=255) ggTTAATGTCACCCCGCAGGACGCTAAAGTAGTGATTAACTCGCGCACCGGTTCGgtggtg  >  1:2346969/1‑61 (MQ=255) ggTTAATGTCACCCCGCAGGACGCTAAAGTAGTGATTAACTCGCGCACCGGTTCGgtggtg  >  1:2722581/1‑61 (MQ=255) ggTTAATGTCACCCCGCAGGACGCTAAAGTAGTGATTAACTCGCGCACCGGTTCGgtggtg  >  1:2838291/1‑61 (MQ=255) ggTTAATGTCACCCCGCAGGACGCTAAAGTAGTGATTAACTCGCGCACCGGTTCGgtggtg  >  1:288431/1‑61 (MQ=255) ggTTAATGTCACCCCGCAGGACGCTAAAGTAGTGATTAACTCGCGCACCGGTTCGgtggtg  >  1:454377/1‑61 (MQ=255) ggTTAATGTCACCCCGCAGGACGCTAAAGTAGTGATTAACTCGCGCACCGGTTCGgtggtg  >  1:546276/1‑61 (MQ=255) ggTTAATGTCACCCCGCAGGACGCTAAAGTAGTGATTAACTCGCGCACCGGTTCGgtggtg  >  1:589919/1‑61 (MQ=255) ggTTAATGTCACCCCGCAGGACGCTAAAGTAGTGATTAACTCGCGCACCGGTTCGgtggtg  >  1:626619/1‑61 (MQ=255) ggTTAATGTCACCCCGCAGGACGCTAAAGTAGTGATTAACTCGCGCACCGGTTCGgtggtg  >  1:646835/1‑61 (MQ=255) ggTTAATGTCACCCCGCAGGACGCTAAAGTAGTGATTAACTCGCGCACCGGTTCGgtggtg  >  1:780742/1‑61 (MQ=255) ggTTAATGTCACCCCGCAGGACGCTAAAGTAGTGATTAACTCGCGCACCGGTTCGgtggtg  >  1:786027/1‑61 (MQ=255) ggTTAATGTCACCCCGCAGGACGCTAAAGTAGTGATTAACTCGCGCACCGGTTCGgtggtg  >  1:849039/1‑61 (MQ=255) ggTTAATGTCACCCCGCAGGACGCTAAAGTAGTGATTAACTCGCGCACCGGTTCGgtggtg  >  1:883158/1‑61 (MQ=255) ggTTAATGTCACCCCGCAGGACGCTAAAGTAGTGATTAACTCGCGCACCGGTTCGgtggtg  >  1:2350204/1‑61 (MQ=255) ggTTAATGTCACCCCGCAGGACGCTAAAGTAGTGATTAACTCGCGCACCGGTTCGgtggtg  >  1:1223672/1‑61 (MQ=255) ggTTAATGTCACCCCGCAGGACGCTAAAGTAGTGATTAACTCGCGCACCGGTTCGgtggtg  >  1:233570/1‑61 (MQ=255) ggTTAATGTCACCCCGCAGGACGCTAAAGTAGTGATTAACTCGCGCACCGGTTCGgtggtg  >  1:2201265/1‑61 (MQ=255) ggTTAATGTCACCCCGCAGGACGCTAAAGTAGTGATTAACTCGCGCACCGGTTCGgtggtg  >  1:2196250/1‑61 (MQ=255) ggTTAATGTCACCCCGCAGGACGCTAAAGTAGTGATTAACTCGCGCACCGGTTCGgtggtg  >  1:2140012/1‑61 (MQ=255) ggTTAATGTCACCCCGCAGGACGCTAAAGTAGTGATTAACTCGCGCACCGGTTCGgtggtg  >  1:2069315/1‑61 (MQ=255) ggTTAATGTCACCCCGCAGGACGCTAAAGTAGTGATTAACTCGCGCACCGGTTCGgtggtg  >  1:1943173/1‑61 (MQ=255) ggTTAATGTCACCCCGCAGGACGCTAAAGTAGTGATTAACTCGCGCACCGGTTCGgtggtg  >  1:1696397/1‑61 (MQ=255) ggTTAATGTCACCCCGCAGGACGCTAAAGTAGTGATTAACTCGCGCACCGGTTCGgtggtg  >  1:1626479/1‑61 (MQ=255) ggTTAATGTCACCCCGCAGGACGCTAAAGTAGTGATTAACTCGCGCACCGGTTCGgtggtg  >  1:1518718/1‑61 (MQ=255) ggTTAATGTCACCCCGCAGGACGCTAAAGTAGTGATTAACTCGCGCACCGGTTCGgtggtg  >  1:1293218/1‑61 (MQ=255) ggTTAATGTCACCCCGCAGGACGCTAAAGTAGTGATTAACTCGCGCACCGGTTCGgtggtg  >  1:1287261/1‑61 (MQ=255) ggTTAATGTCACCCCGCAGGACGCTAAAGTAGTGATTAACTCGCGCACCGGTTCGgtggtg  >  1:1270227/1‑61 (MQ=255) |                                                             GGTTAATGTCACCCCGCAGGACGCTAAAGTAGTGATTAACTCGCGCACCGGTTCGGTGGTG  >  W3110S.gb/1138579‑1138639

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑