Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1138769	1138800	32	4 [0]	[0] 21	flgI	predicted flagellar basal body protein

TTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAACGTGGTGCGCGCGCTCAATGCGC  >  W3110S.gb/1138801‑1138862 |                                                              ttCGCTGCAAAGCGTACGTTCCCGCGCCAGCCTCAATAACGTGGTGCGCGCGCTCAATgcgc  >  1:1323582/1‑62 (MQ=255) ttCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAACGTGGTGCGCGCGCTCAATgcgc  >  1:959578/1‑62 (MQ=255) ttCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAACGTGGTGCGCGCGCTCAATgcgc  >  1:1162219/1‑62 (MQ=255) ttCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAACGTGGTGCGCGCGCTCAATgcgc  >  1:910105/1‑62 (MQ=255) ttCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAACGTGGTGCGCGCGCTCAATgcgc  >  1:887989/1‑62 (MQ=255) ttCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAACGTGGTGCGCGCGCTCAATgcgc  >  1:873369/1‑62 (MQ=255) ttCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAACGTGGTGCGCGCGCTCAATgcgc  >  1:856661/1‑62 (MQ=255) ttCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAACGTGGTGCGCGCGCTCAATgcgc  >  1:808184/1‑62 (MQ=255) ttCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAACGTGGTGCGCGCGCTCAATgcgc  >  1:653774/1‑62 (MQ=255) ttCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAACGTGGTGCGCGCGCTCAATgcgc  >  1:534603/1‑62 (MQ=255) ttCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAACGTGGTGCGCGCGCTCAATgcgc  >  1:277293/1‑62 (MQ=255) ttCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAACGTGGTGCGCGCGCTCAATgcgc  >  1:2560496/1‑62 (MQ=255) ttCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAACGTGGTGCGCGCGCTCAATgcgc  >  1:2340886/1‑62 (MQ=255) ttCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAACGTGGTGCGCGCGCTCAATgcgc  >  1:2336861/1‑62 (MQ=255) ttCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAACGTGGTGCGCGCGCTCAATgcgc  >  1:2286413/1‑62 (MQ=255) ttCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAACGTGGTGCGCGCGCTCAATgcgc  >  1:2145489/1‑62 (MQ=255) ttCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAACGTGGTGCGCGCGCTCAATgcgc  >  1:1951711/1‑62 (MQ=255) ttCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAACGTGGTGCGCGCGCTCAATgcgc  >  1:1946350/1‑62 (MQ=255) ttCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAACGTGGTGCGCGCGCTCAATgcgc  >  1:1875307/1‑62 (MQ=255) ttCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAACGTGGTGCGCGCGCTCAATgcgc  >  1:1808753/1‑62 (MQ=255) ttCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAACGTGGTGCGCGCGCTCAATgcg   >  1:565048/1‑61 (MQ=255) |                                                              TTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAACGTGGTGCGCGCGCTCAATGCGC  >  W3110S.gb/1138801‑1138862

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑