Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	1171391	1171393	3	7 [0]	[0] 32	ycfS	conserved hypothetical protein

ATGGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAATTCCCTGT  >  W3110S.gb/1171394‑1171451 |                                                          atgGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAATTCCCtgt  <  1:263311/58‑1 (MQ=255) atgGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAATTCCCtgt  <  1:781441/58‑1 (MQ=255) atgGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAATTCCCtgt  <  1:755427/58‑1 (MQ=255) atgGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAATTCCCtgt  <  1:717606/58‑1 (MQ=255) atgGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAATTCCCtgt  <  1:660979/58‑1 (MQ=255) atgGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAATTCCCtgt  <  1:565273/58‑1 (MQ=255) atgGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAATTCCCtgt  <  1:52730/58‑1 (MQ=255) atgGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAATTCCCtgt  <  1:450624/58‑1 (MQ=255) atgGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAATTCCCtgt  <  1:435232/58‑1 (MQ=255) atgGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAATTCCCtgt  <  1:306881/58‑1 (MQ=255) atgGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAATTCCCtgt  <  1:2905581/58‑1 (MQ=255) atgGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAATTCCCtgt  <  1:2835995/58‑1 (MQ=255) atgGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAATTCCCtgt  <  1:2765713/58‑1 (MQ=255) atgGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAATTCCCtgt  <  1:2716741/58‑1 (MQ=255) atgGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAATTCCCtgt  <  1:2648972/58‑1 (MQ=255) atgGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAATTCCCtgt  <  1:1001657/58‑1 (MQ=255) atgGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAATTCCCtgt  <  1:2557542/58‑1 (MQ=255) atgGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAATTCCCtgt  <  1:2506313/58‑1 (MQ=255) atgGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAATTCCCtgt  <  1:235086/58‑1 (MQ=255) atgGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAATTCCCtgt  <  1:2314095/58‑1 (MQ=255) atgGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAATTCCCtgt  <  1:2029877/58‑1 (MQ=255) atgGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAATTCCCtgt  <  1:1978578/58‑1 (MQ=255) atgGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAATTCCCtgt  <  1:1937857/58‑1 (MQ=255) atgGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAATTCCCtgt  <  1:1894223/58‑1 (MQ=255) atgGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAATTCCCtgt  <  1:1816630/58‑1 (MQ=255) atgGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAATTCCCtgt  <  1:1695953/58‑1 (MQ=255) atgGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAATTCCCtgt  <  1:1534856/58‑1 (MQ=255) atgGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAATTCCCtgt  <  1:1526699/58‑1 (MQ=255) atgGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAATTCCCtgt  <  1:1208756/58‑1 (MQ=255) atgGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAATTCCCtgt  <  1:1134198/58‑1 (MQ=255) atgGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAATTCCCtgt  <  1:1097514/58‑1 (MQ=255) atgGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAACTCCCtgt  <  1:63430/58‑1 (MQ=255) |                                                          ATGGCCCATTGGGTTATCCAGTCCAGCCGGCACTACCGCAGGCAACTCAATTCCCTGT  >  W3110S.gb/1171394‑1171451

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑