Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1176060	1176066	7	29 [0]	[0] 31	ycfT	predicted inner membrane protein

AAGAAGCCATCAGCAGATGGCGGCGCAACGGCACCTCTTTAACACAGGTCATTATTGTTGC  >  W3110S.gb/1176067‑1176127 |                                                             aagaagCCATCAGCAGATGGCGGCGCAACGGCACCTCtt                        >  1:2050257/1‑39 (MQ=255) aagaagCCATCAGCAGATGGCGGCGCAACGGCACCTCTTTAac                    >  1:421320/1‑43 (MQ=255) aagaagCCATCAGCAGATGGCGGCGCAACGGCACCTCTTTAACACAGGTCATTAttgtt    >  1:619265/1‑59 (MQ=255) aagaagCCATCAGCAGATGGCGGCGCAACGGCACCTCTTTAACACAGGTCATTATTGTTgc  >  1:2473972/1‑61 (MQ=255) aagaagCCATCAGCAGATGGCGGCGCAACGGCACCTCTTTAACACAGGTCATTATTGTTgc  >  1:977262/1‑61 (MQ=255) aagaagCCATCAGCAGATGGCGGCGCAACGGCACCTCTTTAACACAGGTCATTATTGTTgc  >  1:957391/1‑61 (MQ=255) aagaagCCATCAGCAGATGGCGGCGCAACGGCACCTCTTTAACACAGGTCATTATTGTTgc  >  1:914266/1‑61 (MQ=255) aagaagCCATCAGCAGATGGCGGCGCAACGGCACCTCTTTAACACAGGTCATTATTGTTgc  >  1:836906/1‑61 (MQ=255) aagaagCCATCAGCAGATGGCGGCGCAACGGCACCTCTTTAACACAGGTCATTATTGTTgc  >  1:56897/1‑61 (MQ=255) aagaagCCATCAGCAGATGGCGGCGCAACGGCACCTCTTTAACACAGGTCATTATTGTTgc  >  1:533364/1‑61 (MQ=255) aagaagCCATCAGCAGATGGCGGCGCAACGGCACCTCTTTAACACAGGTCATTATTGTTgc  >  1:515345/1‑61 (MQ=255) aagaagCCATCAGCAGATGGCGGCGCAACGGCACCTCTTTAACACAGGTCATTATTGTTgc  >  1:42808/1‑61 (MQ=255) aagaagCCATCAGCAGATGGCGGCGCAACGGCACCTCTTTAACACAGGTCATTATTGTTgc  >  1:296938/1‑61 (MQ=255) aagaagCCATCAGCAGATGGCGGCGCAACGGCACCTCTTTAACACAGGTCATTATTGTTgc  >  1:2897333/1‑61 (MQ=255) aagaagCCATCAGCAGATGGCGGCGCAACGGCACCTCTTTAACACAGGTCATTATTGTTgc  >  1:2700443/1‑61 (MQ=255) aagaagCCATCAGCAGATGGCGGCGCAACGGCACCTCTTTAACACAGGTCATTATTGTTgc  >  1:2571632/1‑61 (MQ=255) aagaagCCATCAGCAGATGGCGGCGCAACGGCACCTCTTTAACACAGGTCATTATTGTTgc  >  1:2494857/1‑61 (MQ=255) aagaagCCATCAGCAGATGGCGGCGCAACGGCACCTCTTTAACACAGGTCATTATTGTTgc  >  1:1095706/1‑61 (MQ=255) aagaagCCATCAGCAGATGGCGGCGCAACGGCACCTCTTTAACACAGGTCATTATTGTTgc  >  1:246744/1‑61 (MQ=255) aagaagCCATCAGCAGATGGCGGCGCAACGGCACCTCTTTAACACAGGTCATTATTGTTgc  >  1:2252556/1‑61 (MQ=255) aagaagCCATCAGCAGATGGCGGCGCAACGGCACCTCTTTAACACAGGTCATTATTGTTgc  >  1:2230597/1‑61 (MQ=255) aagaagCCATCAGCAGATGGCGGCGCAACGGCACCTCTTTAACACAGGTCATTATTGTTgc  >  1:220267/1‑61 (MQ=255) aagaagCCATCAGCAGATGGCGGCGCAACGGCACCTCTTTAACACAGGTCATTATTGTTgc  >  1:2046628/1‑61 (MQ=255) aagaagCCATCAGCAGATGGCGGCGCAACGGCACCTCTTTAACACAGGTCATTATTGTTgc  >  1:1866230/1‑61 (MQ=255) aagaagCCATCAGCAGATGGCGGCGCAACGGCACCTCTTTAACACAGGTCATTATTGTTgc  >  1:1731238/1‑61 (MQ=255) aagaagCCATCAGCAGATGGCGGCGCAACGGCACCTCTTTAACACAGGTCATTATTGTTgc  >  1:1708543/1‑61 (MQ=255) aagaagCCATCAGCAGATGGCGGCGCAACGGCACCTCTTTAACACAGGTCATTATTGTTgc  >  1:1473480/1‑61 (MQ=255) aagaagCCATCAGCAGATGGCGGCGCAACGGCACCTCTTTAACACAGGTCATTATTGTTgc  >  1:1456402/1‑61 (MQ=255) aagaagCCATCAGCAGATGGCGGCGCAACGGCACCTCTTTAACACAGGTCATTATTGTTgc  >  1:1305005/1‑61 (MQ=255) aagaagCCATCAGCAGATGGCGGCGCAACGGCACCTCTTTAACACAGGTCATTATTGTTgc  >  1:1183893/1‑61 (MQ=255) aagaagCCATCAGCAGATCGCGGCGCAACGGCACCTCTTTAACACAGGTCATTATTGTTgc  >  1:1342540/1‑61 (MQ=255) |                                                             AAGAAGCCATCAGCAGATGGCGGCGCAACGGCACCTCTTTAACACAGGTCATTATTGTTGC  >  W3110S.gb/1176067‑1176127

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑