Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1202142	1202142	1	2 [0]	[0] 21	intE	predicted integrase

CCTTTCCTTTGCTGGTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCA  >  W3110S.gb/1202143‑1202204 |                                                              cctttcctttGCTGGTTGCGATCCTGTCCCTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCa  >  1:12147/1‑62 (MQ=255) cctttcctttGCTGGTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGaa                      >  1:640464/1‑42 (MQ=255) cctttcctttGCTGGTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCa  >  1:2812882/1‑62 (MQ=255) cctttcctttGCTGGTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCa  >  1:752984/1‑62 (MQ=255) cctttcctttGCTGGTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCa  >  1:618272/1‑62 (MQ=255) cctttcctttGCTGGTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCa  >  1:560528/1‑62 (MQ=255) cctttcctttGCTGGTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCa  >  1:531841/1‑62 (MQ=255) cctttcctttGCTGGTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCa  >  1:414802/1‑62 (MQ=255) cctttcctttGCTGGTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCa  >  1:313523/1‑62 (MQ=255) cctttcctttGCTGGTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCa  >  1:2913682/1‑62 (MQ=255) cctttcctttGCTGGTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCa  >  1:2821050/1‑62 (MQ=255) cctttcctttGCTGGTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCa  >  1:2820378/1‑62 (MQ=255) cctttcctttGCTGGTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCa  >  1:1006970/1‑62 (MQ=255) cctttcctttGCTGGTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCa  >  1:277854/1‑62 (MQ=255) cctttcctttGCTGGTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCa  >  1:2238026/1‑62 (MQ=255) cctttcctttGCTGGTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCa  >  1:1734981/1‑62 (MQ=255) cctttcctttGCTGGTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCa  >  1:1722026/1‑62 (MQ=255) cctttcctttGCTGGTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCa  >  1:172077/1‑62 (MQ=255) cctttcctttGCTGGTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCa  >  1:1055401/1‑62 (MQ=255) cctttcctttGCTGGTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCa  >  1:1036082/1‑62 (MQ=255) cctttcctttGCTGGTTGCGATCCTGTCACTGATAGCAAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCa  >  1:2196306/1‑62 (MQ=255) |                                                              CCTTTCCTTTGCTGGTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCA  >  W3110S.gb/1202143‑1202204

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑