Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1211271	1211284	14	28 [0]	[0] 24	pin	site‑specific DNA recombinase

ATCAACAAATGACCAGAACACAGATCTACAACGTAATGCGCTGAACTGTGCAGGATGCGAG  >  W3110S.gb/1211285‑1211345 |                                                             aTCAACAAATGGCCAGAACACAGATCTACAACGTAATGCGCTGAACTGTGCAGGATGCGAg  >  1:2510549/1‑61 (MQ=255) aTCAACAAATGACCAGAACACAGATCTACAACGTAATGCGCTGaa                  >  1:567319/1‑45 (MQ=255) aTCAACAAATGACCAGAACACAGATCTACAACGTAATGCGCTGAACTGTGCAGGATGCg    >  1:590751/1‑59 (MQ=255) aTCAACAAATGACCAGAACACAGATCTACAACGTAATGCGCTGAACTGTGCAGGATGCGAg  >  1:1952014/1‑61 (MQ=255) aTCAACAAATGACCAGAACACAGATCTACAACGTAATGCGCTGAACTGTGCAGGATGCGAg  >  1:960198/1‑61 (MQ=255) aTCAACAAATGACCAGAACACAGATCTACAACGTAATGCGCTGAACTGTGCAGGATGCGAg  >  1:903530/1‑61 (MQ=255) aTCAACAAATGACCAGAACACAGATCTACAACGTAATGCGCTGAACTGTGCAGGATGCGAg  >  1:665562/1‑61 (MQ=255) aTCAACAAATGACCAGAACACAGATCTACAACGTAATGCGCTGAACTGTGCAGGATGCGAg  >  1:507447/1‑61 (MQ=255) aTCAACAAATGACCAGAACACAGATCTACAACGTAATGCGCTGAACTGTGCAGGATGCGAg  >  1:2382543/1‑61 (MQ=255) aTCAACAAATGACCAGAACACAGATCTACAACGTAATGCGCTGAACTGTGCAGGATGCGAg  >  1:2291045/1‑61 (MQ=255) aTCAACAAATGACCAGAACACAGATCTACAACGTAATGCGCTGAACTGTGCAGGATGCGAg  >  1:2222214/1‑61 (MQ=255) aTCAACAAATGACCAGAACACAGATCTACAACGTAATGCGCTGAACTGTGCAGGATGCGAg  >  1:2034725/1‑61 (MQ=255) aTCAACAAATGACCAGAACACAGATCTACAACGTAATGCGCTGAACTGTGCAGGATGCGAg  >  1:1049448/1‑61 (MQ=255) aTCAACAAATGACCAGAACACAGATCTACAACGTAATGCGCTGAACTGTGCAGGATGCGAg  >  1:1796435/1‑61 (MQ=255) aTCAACAAATGACCAGAACACAGATCTACAACGTAATGCGCTGAACTGTGCAGGATGCGAg  >  1:1749085/1‑61 (MQ=255) aTCAACAAATGACCAGAACACAGATCTACAACGTAATGCGCTGAACTGTGCAGGATGCGAg  >  1:1646478/1‑61 (MQ=255) aTCAACAAATGACCAGAACACAGATCTACAACGTAATGCGCTGAACTGTGCAGGATGCGAg  >  1:1585017/1‑61 (MQ=255) aTCAACAAATGACCAGAACACAGATCTACAACGTAATGCGCTGAACTGTGCAGGATGCGAg  >  1:153826/1‑61 (MQ=255) aTCAACAAATGACCAGAACACAGATCTACAACGTAATGCGCTGAACTGTGCAGGATGCGAg  >  1:1520645/1‑61 (MQ=255) aTCAACAAATGACCAGAACACAGATCTACAACGTAATGCGCTGAACTGTGCAGGATGCGAg  >  1:1482626/1‑61 (MQ=255) aTCAACAAATGACCAGAACACAGATCTACAACGTAATGCGCTGAACTGTGCAGGATGCGAg  >  1:132986/1‑61 (MQ=255) aTCAACAAATGACCAGAACACAGATCTACAACGTAATGCGCTGAACTGTGCAGGATGCGAg  >  1:1140307/1‑61 (MQ=255) aTCAACAAATGACCAGAACACAGATCTACAACGTAATGCGCTGAACTGTGCAGGATGCGAg  >  1:106910/1‑61 (MQ=255) aTCAACAAATGACCAGAACACAGATCTACAACGTAAAGCGCTGa                   >  1:1440638/1‑44 (MQ=255) |                                                             ATCAACAAATGACCAGAACACAGATCTACAACGTAATGCGCTGAACTGTGCAGGATGCGAG  >  W3110S.gb/1211285‑1211345

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑