Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1228041	1228056	16	10 [0]	[0] 42	minC/ycgJ	cell division inhibitor/hypothetical protein

CGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAT  >  W3110S.gb/1228057‑1228118 |                                                              cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCATGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCCGTTTTg    >  1:430006/1‑60 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTaa                          >  1:2213157/1‑38 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAgg                >  1:2478167/1‑48 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCgg         >  1:2161905/1‑55 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGa   >  1:239058/1‑61 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGa   >  1:2498458/1‑61 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:412847/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:2354988/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:2432808/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:2613600/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:2683130/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:2870117/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:2256588/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:492709/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:607164/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:667838/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:680317/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:805744/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:860836/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:864505/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:867655/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:90592/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:1806980/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:1086536/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:1123019/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:1298045/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:1327458/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:1330024/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:1359367/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:1560367/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:1632225/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:1053323/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:1811107/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:2053785/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:2064510/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:208376/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:2099118/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:2130948/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:2177918/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:2205534/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAt  >  1:2223251/1‑62 (MQ=255) cGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTCTGAt  >  1:761353/1‑62 (MQ=255) |                                                              CGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGAT  >  W3110S.gb/1228057‑1228118

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑